蛋白质吸附的分子动力学模拟——界面性质的影响

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本文根据蛋白质分子结构的特点,采用刚体模型,对聚十赖氨酸分子在固液界面上的吸附过程进行了分子动力学模拟。在NVT条件下,模拟聚十赖氨酸吸附过程在三种不同界面条件下的构象变化。 模拟过程中采用部分刚体模拟和简化的势能函数形式,使计算效率得到了提高。而吸附过程中,侧链和主链的构象发生了明显的变化。主链构象的变化导致了蛋白质分子中α螺旋结构被破坏。聚十赖氨酸的分子性质,如体积和偶极矩随构象变化也相应地发生了变化。 界面性质对蛋白质分子吸附过程中主链构象、侧链构象、二面角等方面变化有重要影响,界面作用越强构象变化越大,蛋白质分子中的α螺旋结构破坏得越严重,这一模拟结果与实验相一致。
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