本研究以新疆野生欧洲李、伽师酸梅、塔城酸梅、塔城槟子、国外引进欧洲李品种共5个类型30个单株为研究对象,通过观测比较它们在植物学特征,花粉微观形态特征,染色体核型特征以及ISSR分子标记遗传特征上的异同,揭示新疆欧洲李种质资源特征及其亲缘关系,为更好地保护和利用新疆欧洲李种质资源奠定理论基础。研究结果显示:1.30个供试欧洲李单株在花梗长度、花冠直径等58项植物学特征指标上均具有不同程度的多样性,其中单果重变异系数最高,达69.8%,花瓣数变异系数最小,仅5.4%。“果实重量因子”、“雌蕊因子”、“叶片大小因子”、“内在品质因子”、“叶片形状因子”等11个累计贡献率达89.662%的主因子是造成新疆欧洲李种质资源植物学特征差异的主要原因。植物学特征聚类表明,野生欧洲李与以伽师酸梅为首的本地酸梅品种关系较近,国外引进欧洲李品种与以塔城槟子为首的塔城欧洲李资源关系较近。2.供试欧洲李花粉粒均为等极而辐射对称的单粒花粉,形状多为长球形,萌发器官属N3P4C3型,极轴均值在27.70~41.47μm之间,赤道轴均值在14.67~21.34μm之间,极轴和赤道轴的变异系数分别为8.88%和7.51%。外壁纹饰类型中,塔城槟子和塔城酸梅基本都属于“条纹-穿孔”,伽师酸梅、国外引进欧洲李品种和野生欧洲李分别为“疣状-穿孔”、“条纹/脑纹-穿孔”和“宽条纹/疣状-穿孔”。据外壁纹饰,新疆欧洲李种质类型的进化程度由低到高为:伽师酸梅、野生欧洲李、国外引进欧洲李品种、塔城酸梅、塔城槟子。花粉形态特征聚类表明,伽师酸梅和野生欧洲李的亲缘关系较近,而国外引进欧洲李品种和塔城欧洲李资源的亲缘关系较近。3.5个欧洲李类型均为含48条染色体的六倍体(2n=6x=48),各类型的m和sm染色体数量不尽相同,均含L、M2、M1和s四种相对长度的染色体。各欧洲李类型的染色体平均臂比范围为1.46~1.69,核型不对称系数范围为59.13~62.34%,核型类型均为2B型。欧洲李染色体核型进化趋势总体由对称向不对称发展。基于核型特征的聚类显示,国外引进欧洲李品种与塔城槟子具有较近的亲缘关系,塔城酸梅和野生欧洲李的亲缘关系较近,而伽师酸梅在核型特征上有一定的特殊性。4.30个供试欧洲李单株的ISSR分子标记显示,16个引物共扩增出317条带,其中多态性条带达77.60%。5个欧洲李种质类型内部的基因多样度(Hs)为0.090 1,Nei’s遗传分化系数(Gst)为0.647 1,不同种质类型间的基因流(Nm)为0.272 7,单株间相似系数范围为0.555 2~0.996 8。供试新疆欧洲李总体具有一定的遗传多样性,5个欧洲李种质类型间的遗传变异大于各种质类型内部的遗传变异。聚类显示,在相似系数0.719和0.949处,供试单株共被划分为4组,其中遗传多样性最低的是野生欧洲李组,最丰富的是塔城酸梅和塔城槟子组,伽师酸梅与野生欧洲李的亲缘关系很近,国外引进欧洲李品种与塔城酸梅及塔城槟子的亲缘关系较近。