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背景:表观遗传学是研究不涉及核DNA序列变化的可逆的、可遗传的表型。表观遗传学是一个具有稳定遗传特征的遗传学分支,一般意义上认为的化学修饰主要包括DNA和RNA甲基化、组蛋白修饰等。与DNA甲基化修饰相似,N~6-甲基腺苷(m~6A)作为整个转录组中最常见的转录后RNA修饰在最近几年中引起了很多的关注。m~6A甲基化修饰可由m~6A“编码器”发生甲基化,编码器是由核心催化组分(METTL3/METTL14/WTAP)和以及其他调节剂因子组成的,并由m~6A甲基化“擦码器”(FTO和ALKBH5)发生去甲基化。m~6A的功能由直接与m~6A“读码器”(主要是包括含有YTH结构域的蛋白质)执行。材料以及方法:我们选取4对胃癌组织以及相对应的癌旁组织,借助于MeRIP-seq等实验技术,首次构建胃癌了m~6A转录组修饰图谱,并深度揭示RNA m~6A甲基化修饰在胃癌和正常癌旁组织间的共性和差异性的调控功能。结果:1.利用MeRIP-seq技术,我们共检测4对胃癌以及癌旁正常胃组织的m~6A数据,我们发现m~6A甲基化修饰模式在胃癌和正常癌旁组织中存在差异。从胃癌以及正常癌旁胃组织分别存在5814和4093个m~6A peaks,分别相关联4259和3174个基因的转录本。但是,在胃癌组织和正常胃组织中都检测到1039个m~6A peaks(仅仅占肿瘤和正常组所有peaks中的12%)以及相关联的1637个m~6A修饰基因(同样仅仅占肿瘤和正常组所有m~6A修饰基因中的28%)。2.m~6A甲基化经典识别序列是保守存在于胃癌以及正常癌旁组织中。我们发现无论在胃癌以及正常癌旁组织中,m~6A peak在CDS和终止密码子附近丰富,其次是起始密码子和3’UTR,并具有一致的motif,即RRACH序列(R:A/G,H:A/C/U)。3.通过MeRIP-seq技术,我们发现272个差异m~6A甲基化位点(FC>2,p<0.05),在这些差异甲基化位点其中的包括188个为高甲基化位点,84个低甲基化位点。随后我们对这272个差异甲基化位点相对应的基因进行生物信息学分析。结果表明,包含有差异m~6A甲基化位点的基因参与多种于肿瘤形成有关的通路,包括癌症通路、基底细胞癌通路、Wnt信号通路、HTLV-I感染、ErbB信号通路。各种途径可能彼此相关,从而形成复杂的信号调节网络,其参与胃癌的发生和发展。这些差异甲基化的基因及其信号调节途径可能是胃癌治疗的新靶标。4.通过RNA-seq技术,我们在胃癌以及癌旁正常胃组织中检测出大约共有20348个mRNAs,然后发现有3069个差异表达的mRNAs(FC>2,p<0.05),其中2032个mRNAs表达上调,1037个mRNAs表达下调。然后同样的我们对这这些差异表达的基因行生物信息学分析。5.接下来我们结合m~6A-seq以及RNA-seq检测结果,分析了差异m~6A甲基化修饰的基因与其mRNA表达水平之间的关系。我们发现,m~6A高甲基化修饰基因倾向于高表达,m~6A低甲基化基因倾向于低表达。结论:本研究首次提出了人类胃癌的m~6A转录组修饰图谱,阐述了差异m~6A甲基化修饰与肿瘤相关基因表达之间的潜在联系,并为进一步研究胃癌中的m~6A修饰提供一些启示。