本论文共包括三部分内容：第一篇：GAE结构域对辅助蛋白结合的特异性囊泡转运和分泌过程是生命活动的基本事件之一。在高尔基体至溶酶体的运输中,网格蛋白包被囊泡起主要作用。在酵母中,GGA2,Ent3,Ent5是这一过程的三种重要接头蛋白。Ent3和Ent5功能相似,却又具有不同特点。它们和GGA2的相互作用是它们发挥不同功能的重要一环。以前的研究指出Ent3和Ent5中有一些和GGA2相互结合的模体,但是人们并不清楚这些模体是不是真的能够和GGA2结合以及如何结合。我们实验证实,Ent3中涉及的三个模体只有两个可以和GGA2有效结合,而Ent5中涉及的两个模体中只有一个可以和GGA2有效结合。为了阐明GGA2是选择性结合这些模体的机制,我们解析了GGA2的GAE结构域1.8埃分辨率的晶体结构。通过拼接模拟,突变实验,我们指出+1和+3位是GGA2对Ent3和Ent5中模体进行选择的重要位点。我们进一步提出了GGA2和Ent3、Ent5协同作用的模型。第二篇：大肠杆菌异天冬氨酸甲基转移酶的结构生物学研究去酰胺化是一类常见的蛋白质损伤类型,在这种损伤的蛋白质中,天冬氨酸转变为异天冬氨酸。异天冬氨酸甲基转移酶可以识别异天冬氨酸,对损伤蛋白进行修复。细菌中异天冬氨酸甲基转移酶比人和其他高等生物中的活性要低。我们解析了2.1埃分辨率的大肠杆菌异天冬氨酸甲基转移酶结合配体的晶体结构。我们推测,大肠杆菌异天冬氨酸甲基转移酶对于反应产物过强的结合能力,是导致它活性低的原因。第三篇：大肠杆菌RNase G的初步晶体学分析RNase G是大肠杆菌中一类特殊的RNA酶。它不光对于mRNA的降解,rRNA的成熟起关键作用,而且它还涉及到大肠杆菌细胞骨架的形成。我们纯化表达了RNase G蛋白,并且获得了RNase G晶体的x射线衍射数据。为进一步研究其结构特点,生化功能提供了良好基础。