福尔马林固定石蜡包埋（Formalin-fixed paraffin-embedded,FFPE）组织含有大量疾病相关信息,是回顾性研究最常见的材料。由于FFPE的制作方式,从FFPE组织提取的DNA质量差,检测时常出现C:G>T:A假突变。在基于LNA或PNA等具有压制效果的检测方法中,假突变出现频率更高。本论文以消除压制体系检测FFPE标本时出现的假突变为研究目的,使用Cod UNG酶修复结合高保真DNA聚合酶预富集技术,建立了一种FFPE标本预处理方法。第一章为绪论部分,介绍了 FFPE标本的制作过程、损伤类型、对突变检测的影响以及提高FFPE标本质量的方法,并提出了本论文的研究内容。第二章分别对储存4年、3年、2年和1年的结直肠癌（Colorectal cancer,CRC）FFPE标本进行片段化分析。首先将标本进行毛细管电泳（Capillary electrophoresis,CE）检测,发现储存时间越久,DNA的主峰越小。接着进行qPCR检测,发现随着扩增子长度增加,标本的Ct值逐渐靠后。这两个现象表明FFPE储存越久,质量越差,并且不适合用于长片段扩增。第三章以本实验室建立的PIK3CA LPO-MMCA体系为检测技术,建立了FFPE预处理方案并进行应用评价。对UNG酶消除假突变的能力进行考察,发现结直肠癌FFPE标本经UNG酶处理后突变率下降了 19.5%,说明UNG酶能有效消除非特异。对不同的UNG酶进行筛选,选择作用效果较好的Cod UNG酶。对Cod UNG酶修复结合高保真DNA聚合酶预富集的预处理方式进行考察,将19名乳腺癌（Breast cancer,BC）患者的癌组织和癌旁组织FFPE标本作为研究对象,发现19份癌旁组织经过预处理后,非特异消失。19份配对的癌组织中11例检测到PIK3CA突变,除A18外均经过数字PCR验证。表明利用该方法,既能够消除假突变,又不影响真实突变的检测。根据标本PCR效率的高低,提出FFPE标本的检测方案,并对临床标本进行检测。在77份有效的结直肠癌FFPE标本中检出14份阳性标本,与数字PCR的一致率、灵敏度和特异性均为100%。17份有效的乳腺癌FFPE标本中检出10份阳性标本,与数字PCR的一致率为94.1%、灵敏度为100%、特异性为87.5%。LPO-MMCA体系比数字PCR多检出1份阳性,推测是由于预富集后拷贝数仍然偏低,取样误差导致了突变漏检。综上,本论文对FFPE标本的片段化程度进行研究,并建立了 Cod UNG酶修复结合高保真DNA聚合酶预富集技术的预处理方法,提高了 FFPE标本进行压制体系检测的准确性,解决了由于标本质量引起的假突变问题。该技术策略也有望应用于其他灵敏度较高的分子诊断技术中,在肿瘤组织活检领域具有广泛的应用前景。