“三农”问题是社会主义现代化建设的首要问题。随着农村经济的发展,单一滞后的金融供给模式越来越难以满足农民对金融服务的需求,再加上新农村建设需要大量的新增资金,使得农村地区存在着巨大的资金供给缺口,国家提出设立新型农村金融机构就是为了解决农村金融供给不足和“三农”贷款难问题。在五年的发展过程中,村镇银行最受国家重视,发展速度最快,然而,运行过程中也出现了一系列问题,如融资难、内部治理混乱、监管不利、发起动力不足等。本文认为出现上述问题的最根本原因在于运行机制不健全,包括融资机制不顺畅、治理机制不完善等。在这种背景下,本文运用比较分析、制度分析和统计分析等方法,在深入研究农村金融发展理论、村镇银行发展历程和相关政策演变的基础上,借鉴国外成功模式经验,探索了现行村镇银行的运行现状,从理论和实践角度分析我国村镇银行运行机制存在的问题及原因,得出以下结论: (1)村镇银行的设立有助于缓解农村金融供给不足、正规金融服务缺位的现状;(2)在国家政策的积极支持引导下,村镇银行整体运行态势良好,组织模式不断创新;(3)由于相关法律的缺失、发展经验的缺乏以及村镇银行自身组织结构不合理等原因,我国村镇银行在运行中出现了多种问题亟待解决。其中,融资困难是制约其发展的最主要因素;(4)完善村镇银行法律法规的和加大政府的支持力度对解决村镇银行运行过程中出现的问题至关重要。本论文不仅能够提供当前我国村镇银行较全面详细的信息,并且研究具有较好的政策指导意义:要想使村镇银行实现商业可持续发展就要增加融资渠道,理顺融资机制;创新股权结构,完善治理机制;加强金融监管,健全监管机制;加大政策扶持,均衡激励机制。希望通过本论文的研究,为村镇银行实现商业可持续发展提供一些启示。