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【目的】 1. 利用基因表达谱检测在B-ALL与T-ALL表达差异的lncRNA。 2. 研究表达差异较明显的lncRNA-TCONS_00029175在急性淋巴系白血病细胞B-ALL与T-ALL中对自噬的影响。 3. 探讨lncRNA-TCONS_00029175在B-ALL与T-ALL中影响自噬的潜在分子机制。 【方法】 1.对收集到的22例小儿急性淋巴细胞白血病骨髓样品(11例B-ALL,11例T-ALL)及6例正常小儿进行lncRNA表达谱及基因表达谱检测。 2.在临床样品和细胞株中利用荧光定量PCR验证lncRNA在B-ALL和T-ALL中的表达是否与表达谱芯片结果相一致。 3. 采用信息学分析方法构建基因网络图,探讨可能与TCONS_00029175有相互联系的基因。 4.在ALL中的B系SUP-B15和T系的Jurkat中敲低TCONS_00029175,在电镜和western blot水平上检测其是否发生自噬。 5.采用western blot技术检测TCONS_00029175是否可能通过调控Beclin1相关自噬通路降低了B-ALL和T-ALL细胞的自噬水平。 【结果】 1. 对前期收集到的22例小儿急性淋巴细胞白血病骨髓样品(11例 B-ALL, 11例T-ALL)及6例正常小儿临床骨髓样品进行了lncRNA的表达谱检测。芯片结果显示,lncRNA 的表达谱可有效区分 B-ALL 与 T-ALL,表明了两者的lncRNA表达谱不同。 2. 扩大临床样本量对收集到的另外共115例的验证组,包括64例B-ALL, 43例T-ALL和8例正常小儿的骨髓样品采用real-time RT-PCR技术进行了验证, 结果证实跟正常对照相比,TCONS_00029175在B-ALL与T-ALL中表达趋势相反并有显著差异性。并且在两种B-ALL细胞株(SUP-B15和RS4;11)以及两种T-ALL细胞株(Jurkat和CCRF-CEM)进行检测,发现TCONS_00029175在B-ALL与T-ALL细胞株中表达的差异趋势与临床样本一致。 3. 对前期收集到的22例小儿急性淋巴细胞白血病骨髓样品(11例 B-ALL, 11例T-ALL)及6例正常小儿临床骨髓样品进行了基因芯片表达检测。通过基因网络图分析,发现TCONS_00029175与较多与自噬相关的基因相互联系,如CAMK4,SGPP1,FLT3,ELK3,AGRP,CD7,APOBEC2,RAB13,HMGCR, SOCS2,GCLC,CTGF,CD9等。 4.结合电镜图片和自噬标志蛋白LC3B的western blot结果显示,在B-ALL中表达升高的 TCONS_00029175 可以抑制 B-ALL 中细胞的自噬水平,而在T-ALL中表达降低的TCONS_00029175抑制了T-ALL细胞中的自噬水平。 5.敲低TCONS_00029175导致SUP-B15细胞Beclin1的表达升高但引起Jurkat细胞Beclin1的表达降低,表明在B-ALL中表达升高的TCONS_00029175可以抑制 Beclin1 的表达从而抑制自噬水平,而在 T-ALL 中表达降低的TCONS_00029175也是可以抑制Beclin1的表达进而抑制自噬水平。 6.核质分离实验表明,TCONS_00029175在细胞核和细胞质内均有分布,主要分布于核内。 【结论】 1. 芯片结果表明,ALL的不同亚型B-ALL与T-ALL有着各自独特的lncRNA表达谱和基因表达谱。 2. 针对TCONS_00029175在129例验证组临床样本以及细胞系的real-time RT-PCR检测结果表明,其表达与芯片结果一致。 3. B-ALL与T-ALL中表达相反的TCONS_00029175可能通过调控Beclin1参与的通路降低了B-ALL和T-ALL细胞的自噬水平而促进了B-ALL和T-ALL的发展。 4. 核质分离实验表明,TCONS_00029175在胞核和胞质均有分布,且主要分布于核内,表明该lncRNA可能在调控基因的转录水平发挥着更为重要的功能。