铅锌矿区污染土壤刺槐根瘤中几株内生细菌的多相分类研究

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课题组前期研究汉中铅锌矿区污染土壤中刺槐根瘤内生菌多样性时,经过16S rDNA系统发育分析发现四株潜在新种,需进一步研究。因此本研究是采用多相分类方法对这四株潜在新种进行研究,确定其分类学地位。表型特征研究结果:菌株HZ7,菌落大小2~5 mm,圆形凸起,半透明,细胞呈棒状,大小0.3×1.5~2μm,有一根端生鞭毛,革兰氏染色阴性,甲基红阴性,pH生长范围为5~10,温度生长范围4~45℃,在4℃和45℃时生长比较慢,长势弱,能在含有0%~1%NaCl的YMA培养基上生长,对氧氟沙星、头孢噻肟等抗生素比较敏感。菌株HZ10,菌落大小3~5 mm,圆形凸起,细胞呈曲杆状,大小0.3×1.0~1.5μm,有两根端生鞭毛,革兰氏染色阴性,甲基红阴性,pH生长范围为5~9,在pH为9时,生长比较慢,温度生长范围4~45℃,在4℃和45℃时生长比较慢,长势弱,能在含有0%~1%NaCl的YMA培养基上生长,对卡那霉素、链霉素等抗生素比较敏感。菌株HZ28和HZ34,菌落大小2~3 mm,圆形凸起,细胞呈短杆状,大小0.3×1μm,细胞表面的褶皱比较明显,有一根端生鞭毛,革兰氏染色阴性,甲基红阴性,pH生长范围为5~9,温度生长范围20~37℃,在温度为10℃时,菌株HZ28和HZ34生长比较弱,菌株HZ28能在含有0%~1%NaCl的YMA培养基上生长,菌株HZ34则可以在含有0%~3%NaCl的YMA培养基上生长,对卡那霉素和麦迪霉素比较敏感。细胞化学组分分析结果:菌株HZ7,主要的脂肪酸类型为C16:0(29.9%),Sum In Feature 3(C16:1 w7c和/或C16:1 w6c,34.44%)。菌株HZ10,主要的脂肪酸类型为C16:0(20.87%),Sum In Feature 3(36.55%)及Sum In Feature 8(可能为C18:1 w7c,23.08%)。菌株HZ28,主要的脂肪酸类型为C16:0(36.99%)、C17:0 cyclo(9.86%)和Sum In Feature3(30.03%),菌株HZ34主要的脂肪酸类型为C16:0(32.9%)、C17:0 cyclo(13.18%)和Sum In Feature 3(25.71%)。分子系统学分析结果:基于16S rDNA序列分析,菌株HZ7和Mitsuaria chitosanitabida的相似性最高(99.05%),结合持家基因recA、puf、IGS基因以及DNA的G+C%分析,菌株HZ7为Roseateles内的成员。基于16S rDNA序列分析,菌株HZ10和Herbaspirillum chlorophenolicum相似性最高(98.51%),结合持家基因recA、nifH、IGS基因以及DNA的G+C%分析,菌株HZ10为Herbaspirillum内的成员。基于16S rDNA分析,菌株HZ28、菌株HZ34和Achromobacter insolitus相似性最高(98.22%),结合持家基因recA、IGS基因以及DNA的G+C%分析,菌株HZ28和菌株HZ34为Achromobacter内的成员。综合各项指标检测结果表明,菌株HZ7为Roseateles内的潜在新种。菌株HZ10为Herbaspirillum内的潜在新种。菌株HZ28和HZ34为Achromobacter内的潜在新种。后续还需要对DNA同源性进行分析研究。
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