土生隐球酵母菌中钙调素与钙调磷酸酶的结合位点研究

来源 :昆明理工大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:RyanD
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
钙离子是细胞中最广泛和多样化的第二信使。钙调素则是一个小的,无处不在的蛋白质,并作为信号蛋白介导钙离子信号。钙调素可以激活许多酶,包括一氧化氮合成酶,磷酸二酯酶,钙调素依赖性蛋白激酶,钙调素依赖性蛋白磷酸化酶。钙调磷酸酶是由一个催化亚基A和一个调节亚基B组成的异二聚体。尽管它分布广泛,但是它的序列和结构在许多真核生物中非常保守。钙调磷酸酶在T细胞激活,细胞凋亡,心脏肥大中起着重要作用,并且作为细胞内钙信号的一个广泛的载体。钙调磷酸酶的催化亚基包括催化域,调节亚基结合域,钙调素结合域以及一个自我抑制域。在响应钙离子刺激时,钙调素会与钙调磷酸酶结合。钙调素结合于钙调磷酸酶催化亚基上的钙调素结合域,引起催化亚基构象的改变并使自抑制域从催化域中脱落,从而激活其催化活性。钙调素在催化亚基上的结合序列也称作钙调素的结合基序。Yap等人根据钙调素结合基序的结构以及序列信息建立了一个钙调素靶蛋白数据库(http://calcium. uhnres.utoronto.ca/ctdb)。可以用来预测一个序列是否包括钙调素结合域,并分析结合域中氨基酸的亲水和疏水性。许多依赖于钙离子的钙调素结合基序被鉴定为1-14或者1-10家族,数字表示与钙调素结合的关键的疏水氨基酸的位置。目前仍旧缺乏研究这些与钙调素结合的蛋白质中的关键氨基酸的实验证据。本论文以土生隐球酵母菌为材料,研究钙调磷酸酶的催化亚基与CaM的结合特性。该催化亚基由639个氨基酸组成,其分子量约为71kDa。我们通过构建钙调素结合域的截短突变蛋白来确定钙调素结合域的位置,并通过定点突变研究该结合域中的关键氨基酸。本研究中,我们首先将催化亚基的序列提交至钙调素的靶蛋白数据库中,预测钙调素的结合域并分析与钙调素结合的关键氨基酸,并通过实验来证明。主要的研究结果如下:1、首先将催化亚基的序列提交至钙调素的靶蛋白数据库(http://calcium. uhnres.utoronto.ca/ctdb),这个数据库中包括已经报道的大多数与钙调素结合的序列。催化亚基基因编码一个71kDa的蛋白,其钙调素结合域位于其C端。钙调素结合域中保守的疏水氨基酸残基I439,I443,V446以及V452形成1-5-8-14基序,这种基序代表的氨基酸残基可能是与钙调素结合的关键氨基酸残基。I439和F453则是预测的锚定氨基酸残基,这两个氨基酸残基也可能与钙调素结合。2、为了鉴定预测的钙调素结合域的正确性。通过Far-western blotting技术研究删除突变蛋白和定点突变蛋白与钙调素的结合特性。为了鉴定钙调素结合域,我们将催化亚基基因和它的删除突变蛋白转移至硝酸纤维素膜上,验证它们与钙调素的结合特性。删除突变蛋白ACNAb(删除了S454至A639位置)能够与钙调素结合,而删除突变蛋白ACNAa(删除了R436至A639位置)不能够与钙调素结合,因此验证了R436到S454位置为催化亚基上钙调素结合域的位置。3、为了预测钙调素结合域中与钙调素结合的关键的氨基酸残基。我们突变了这5个预测的保守的疏水氨基酸残基I439,I443,V446,V452,以及F453。结果发现未突变的催化亚基蛋白和钙调素的结合程度要强于5个的定点突变的突变蛋白,并且CNAl和CNA2突变蛋白和钙调素的结合量最小,这证明I439和I443是与钙调素结合的关键氨基酸。4、最后通过PNPP法测定CNA和它的突变蛋白的磷酸酶活性的大小。删除了CaM结合域的△CNAa重组蛋白的磷酸酶活力最低。CNA1 (Ile439)和CNA2 (Ile443)的突变蛋白的磷酸酶的活性非常低,说明第439位和第443位的Ile不仅在与CaM的结合中起着重要作用,而且对酶活性的影响也非常大。
其他文献
接触压力的检测一直是工程应用和力学方面的热点研究课题,尤其是对在两个物体及弹性介质之间的微间隙的物体来说,其表面接触压力的检测具有必要性和重要性。本文针对该类问题
植物的叶片是光合作用的重要器官。而叶片衰老可以直接影响植物在环境中的生存和发育,并最终影响植物的繁殖。在叶片的衰老过程中有多种植物激素和基因参与。到目前为止该过
中国邮政储蓄银行是一家大型零售商业银行,自2007年正式挂牌成立后,业务模式不断更新,各类产品逐渐丰富,正在经历快速增长的阶段。2019年2月,邮储银行被银监会列为国有大型商业银行,与工农中建交五大传统国有商业同列。随着业务规模飞速扩张,人员能力不足的问题日趋暴露,本文以邮储银行天津分行为例进行了具体研究。邮储银行天津分行自2018年以来对公司业务部进行了两次机构改革,改革过程中暴露了对公客户经理
氮素是植物生长必需的重要元素之一,是植物体内蛋白质、核酸、磷脂和某些生长激素的重要组分,在增加作物产量、发展农业生产方面有着不可或缺的作用,对作物最终产量的贡献可
Cathelicidins是一类由N端信号肽区域、中间保守cathelin结构域和C端高度特异的成熟肽区域组成的宿主防御肽,在大多数脊椎动物的天然防御系统中发挥着重要作用。Cathelicidin
信息时代推动了供应链管理的发展与创新,利用现代化的信息技术改进供应链管理薄弱环节,有利于降低企业运营成本,提升企业核心竞争力。高效的信息交换会对拓展供应链的功能产生重要影响,信息价值的关键是供应链网络中信息的实时交换。供应链管理系统(Supply chain management system,SCM)通过接口连接不同的企业资源管理系统(Enterprise Resource Planning,E
层析成像技术可以在不破坏物体的前提下对物体进行重建,从而帮助人们观察物体的内部结构,这使得层析成像技术的应用范围非常广泛。本文比较了目前常用的反演算法,为了提高反
林下经济主要是指在生态经济学理论和林业经济学的指导下,以林地资源和森林生态环境为依托,以市场为导向,以科技为支撑,发展起来的林下种植业、养殖业、采集业和森林旅游业。
利用植物净化空气中的甲醛污染时甲醛主要通过气孔进入植物体内,有研究表明环境中极低浓度甲醛胁迫就能导致植物气孔传导率显著下降,因此气孔的传导率是植物净化甲醛效率的重
本文研究典型的生物及化学系统中的随机和延迟效应。首先介绍了系统的研究现状,包括comK基因表达系统、Schlogl化学反应系统和免疫监视下肿瘤增长系统。然后,在第二章中,阐述