H5N1亚型禽流感自爆发以来,给养禽业带来巨大损失。近年来,高致病性禽流感病毒感染人并导致人死亡的事件不断发生。重组抗原多表位疫苗在一定程度上可以防止其基因组广泛变异而造成的免疫逃避,及时预防和控制禽流感暴发,并且具有较高安全性和免疫针对性,因此越来越受到重视。由于重组抗原表位亚单位疫苗制作的关键在于能否及时选取到有效的的抗原表位,因此抗原表位选择的准确性和快速性这一问题就突显出来。通过对1996-2007年H5N1亚型禽流感病毒HA蛋白序列进行多序列比对,寻找其突变位点,并对HA基因进行进化分析。针对禽流感病毒变异较快,且表位相关报道较少,为禽流感防治工作带来很大困难这一难题,我们尝试了利用基于氨基酸序列信息和基于蛋白3D结构信息,通过计算机操作,对HA蛋白的线性表位和非线性表位的预测,其中,线性抗原表位预测综合了Kolaskar&Tongaonkar及Bepipred算法对抗原表位进行预测,结合Hopp&Woods亲水性参数,Janin可及性参数,Karplus柔韧性参数及Chou-Fasman二级结构参数对预测结果进行筛选,已从模板病毒株Goose/Guangdong/1/1996(Gs/GD)中筛选出6个包含线性表位的氨基酸序列;非线性抗原表位预测在结合了本实验室经验和相关文献的基础上,利用CN3D软件及DiscoTope预测方法,成功筛选出3个包括非线性表位的氨基酸序列。根据非线性表位的预测的3个氨基酸序列,我们合成了相应的基因片段,并成功构建了由上述3种氨基酸序列设计的候选疫苗的多表位基因。