党的十九大报告提出，要瞄准世界科技前沿，强化基础研究，实现前瞻性基础研究、引领性原创成果重大突破。随着国家越来越重视科研事业的发展，国家财政科技支出持续增加，高校作为国家科技创新发展的中坚力量，承担了大部分的科学研究。然而由于滞后的科研经费管理方式，高校科研经费乱象丛生。为此，中央及地方政府纷纷出台了各类管理办法，但高校科研经费管理依旧陷在“一抓就死，一放就乱”的怪圈。如何充分发挥科研经费的价值，保障高校科研工作持续、稳定、健康发展，具有强烈的现实意义。　　本文在《关于进一步完善中央财政科研项目资金管理等政策的若干意见》（中办发［2016］50号）出台后，高校科研经费进入新一轮“松绑式”政策背景下，系统梳理了当前高校科研经费申请、使用、监督和评价四个方面存在的问题；然后以A高校为例，概述其近年来的科研发展情况和科研经费管理现状，并对A高校科研经费管理中存在的问题进行了分析；结合委托代理理论，以“动机-行为-结果”框架分析了高校科研经费申请、使用、监督方面产生问题的原因。最后运用理论从加大信息公开力度，即减少非对称信息；完善激励机制，即激励手段；健全高校内部控制，即约束手段；强化科研人员责任意识，即道德手段四个方面，提出加强高校科研经费管理的建议。其中高校内部控制分析结合了笔者科研管理工作的实际经验，以COSO内部控制框架，从内部环境、风险评估、控制活动、信息与沟通、内部监督五要素进行系统阐述，以期改善高校科研经费管理现状，促进科研事业健康发展。