【摘 要】
:
R-Loop是一种独特的三链染色质结构,不仅参与多种重要的生物学过程,例如基因的表达调控,染色质结构状态,DNA损伤修复等,并且R-Loop的调控失调与多种人类疾病息息相关,包括乳腺癌,神经退行性疾病还有骨髓增生异常综合征等。准确而全面地分析基因组中的R-Loop对于研究其在生理和病理条件下的功能至关重要。然而,现有的方法在R-Loop的映射上存在较大的差异,因此迫切的需要提供一种独立的策略。在这
论文部分内容阅读
R-Loop是一种独特的三链染色质结构,不仅参与多种重要的生物学过程,例如基因的表达调控,染色质结构状态,DNA损伤修复等,并且R-Loop的调控失调与多种人类疾病息息相关,包括乳腺癌,神经退行性疾病还有骨髓增生异常综合征等。准确而全面地分析基因组中的R-Loop对于研究其在生理和病理条件下的功能至关重要。然而,现有的方法在R-Loop的映射上存在较大的差异,因此迫切的需要提供一种独立的策略。在这份研究中,我们构建了一个带有RNase H1杂交结合域(HBD)串联重复序列的DNA:RNA杂交体识别蛋白GST-His6-2XHBD,发现它不仅能在体外与DNA:RNA杂交体特异性的结合,并且利用DRIPc-seq策略捕获到的信号与目前S9.6单克隆抗体检测到的R-Loop信号高度相似。我们进一步的将GST-His6-2XHBD和S9.6与基于Tn5的靶向切割和标记方法相结合,建立了一个新的独立的R-Loop全基因组定位方法R-Loop CUT&TAG。与之前的R-Loop定位方法相比,R-Loop CUT&TAG捕获到的R-Loop信号显示出更高的特异性,并能在基因体和增强子区域检测到瞬时形成的R-Loop。我们的结果证明R-Loop CUT&TAG是一种高特异性的,可重复的,并且操作简便的高分辨率体内原位R-Loop捕获方法。此外,GST-His6-2XHBD和S9.6抗体具有相同的R-Loop CUT&TAG图谱,但不同于它们的DRIPc-seq信号,这说明不同R-Loop定位方法产生的R-Loop图谱的差异主要是因为不同的R-Loop捕获策略所导致,而不是识别因子本身。总结来看,我们的研究不仅为天然R-Loop的全基因组分析提供了一种全新的独立策略,而且有助于解决多种R-Loop定位方法之间存在的差异。
其他文献
众所周知,糖尿病的典型症状是"三多一少",遗憾的是,具备典型症状的糖尿病患者尚不足全部的一半,许多患者症状并不典型,所以更值得注意,临床常见的如下:1、餐前低血糖在糖尿病的初期,有些患者并没有典型的"三多一少"症状,而是常常表现为餐前饥饿难忍及低血糖。其原因是由于2型糖尿病患者胰岛素分泌延迟,与血糖的变化不同步,餐后血糖达高峰时,胰岛素分泌却没达峰值,到下一餐前血糖
传输不等式的研究是概率统计中一个非常重要的课题,其中Talagrand不等式与测度的集中现象,对数索伯列夫不等式,庞加莱不等式有着紧密的联系.本文主要研究了空间是由分数布朗运动噪声驱动的随机热方程和带平均反射的倒向随机微分方程的传输不等式.本文总共分为四章,其中第一章介绍了传输不等式基础知识以及国内外研究现状.第二章第一节主要介绍了带平均反射倒向随机微分方程的研究背景以及确定性平坦解的定义,第二、
本文介绍了被广泛研究的积分算子的一种推广形式,并刻画了这类广义积分算子Tg,a从一个加权Bergman空间Aα到另一个加权Bergman空间Aβ的有界性及紧性条件.
传输不等式的研究是概率统计中一个非常重要的课题,其中Talagrand不等式与测度的集中现象,对数索伯列夫不等式,庞加莱不等式有着紧密的联系.本文主要研究了空间是由分数布朗运动噪声驱动的随机热方程和带平均反射的倒向随机微分方程的传输不等式.本文总共分为四章,其中第一章介绍了传输不等式基础知识以及国内外研究现状.第二章第一节主要介绍了带平均反射倒向随机微分方程的研究背景以及确定性平坦解的定义,第二、
在多复变,代数几何以及复几何中,L2延拓定理非常重要并且有很多应用.而其中一个有趣的问题则是研究关于激流的L2延拓定理.本文第一部分通过研究周向宇-朱朗峰引入的变量分母,推广了 D.Popovici关于激流的L2延拓定理[Po05]的结果.作为一个直接的推论,我们同样将T.Ohsawa-K.Takegoshi经典的延拓定理[OT87]推广到激流情形.在射影流形上,L.Katzarkov-M.Kon
本文引入了量子欧式空间上的α-模空间,研究了该函数空间上的对偶,插值,嵌入等理论.并给出了Schr?dinger群在α-模空间中的有界性以及Strichartz估计.
目的:吡咯里西啶生物碱(pyrrolizidine alkaloids,PAs)是一类对动物和人均具有毒性的天然植物成分。含有PAs成分的膳食补充剂、中草药等在我国民间被普遍使用。PAs本身无毒或低毒性,需经肝细胞色素P450(cytochrome P450,CYP)酶代谢活化后发挥肝毒性。动物实验及临床案例报道均表明,孕期PAs暴露可引起发育毒性,致胎儿流产、宫内生长受限,甚至死胎。本室前期研究
本文考虑了一类带记忆项的非经典热方程,证明解会在有限时间爆破,而且爆破只会发生在边界.主要结论是:首先利用Green函数与Banach压缩映射定理,建立了问题的经典解;其次,利用经典解,证明了解是有限时间爆破的;最后,证明了一个关于非经典热方程解的性质,利用这个性质,证明了解是在边界上爆破的.
钼氧化物因Mo元素具有多种价态,在光学和电学等方面被广泛应用。其中,MoO3具有生态友好性以及很高的Mo6+/Mo4+氧化还原活性,引入氧空位可以降低Mo的价态,并提高材料的氧化还原活性。因此,研究MoO3在氧空位引入后的结构演变及稳定性是实现其工业化运用的前提。一般情况下,氧空位的引入会引起MoO3的结构变化,然而,原子尺度的相变过程及机理的认识还比较缺乏,所以需要在原子尺度原位表征MoO3的结
本文考虑如下的拟线性方程(?)其中M是一个维数N≥ 3紧致光滑无边Riemann流形,x0∈ ∈M.这里a(x),K(x)以及h(x)都是M上的连续函数还满足其他一些条件.算子△p,g称为流形M上相对于度量g的p-Laplace-Beltrami算子,这里dg是(M,g)上的Riemann距离.此外,我们假设p ∈(1,N),s ∈[0,p),且r ∈(p,p*)其中(?).记号(?)是临界Har