当代中国非政府组织作为独立于政府和企业之外,致力于社会公益事业的具有非政府性、非营利性、自主性的社会中介组织,已成为当代中国社会越来越重要的社会组织,它以公益性为其本质属性,以公益性追求为其道德使命：即坚持将公共利益、公众福利作为自身存在发展的价值所在,对社会生产力发展、社会环境改善具有积极作用,对公众尤其是社会当中那些需要帮助的人有益,这是考察非政府组织行为意义价值的衡量标准。当代中国非政府组织这种道德使命及公益努力集中体现着组织的道德性质,明确了非政府组织的核心道德责任,并要求当代中国非政府组织树立仁爱、人道、正义、和谐的道德精神。现实生活中,越来越多的非政府组织在扶贫开发、权益维护、环境保护、社会服务等方面发挥着越来越重要的作用,得到了来自政府、社会、民众不同程度的认可,也吸引了越来越多的志愿者参与其中。当代中国非政府组织先天的合伦理性及后天的公益努力,使其逐渐成为社会生活中重要的道义性组织。然而理想与现实总是有差距,当代中国非政府组织坚持公益性追求由于受到自身定位失策、组织能力不足、行业自律欠缺、外部环境不利等因素的影响,亦存在着官僚作风、贪污腐败、弄虚作假、欺骗大众等非道德行为,这些非道德行为背后反应的是组织自主性不强、消极作为、公平缺失、谋求私利等道德问题。解决这些道德问题,有效实现公益性追求,需要当代中国非政府组织清醒地认识自身在合法性、诚信、志愿、供需等方面存在的伦理困境,并针对这些伦理困境,树立责任、志愿、公平、尊重等道德原则,在组织内部进行道德教育,建立自律机制,提高履行责任的能力；在组织外部健全相关法制,强化政府规制,完善社会监督机制。通过内外部的共同努力,使当代中国非政府组织从内到外都成为沟通助人者与被助者的重要桥梁,成为社会公益事业的重要主体,成为构建社会主义和谐社会的积极力量。