论文部分内容阅读
目的:探究ORMDL3与HLA-DQ基因单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphisms,SNPs)在儿童肺炎支原体(Mycoplasma pneumoniae,MP)感染相关哮喘中的分布情况及基因-基因交互作用。方法:选取2015年1月至2015年12月MP感染住院患儿200例,随访观察一年,有反复或持续咳嗽及喘息表现,诊断哮喘者为MP-哮喘组;无上述表现,未诊断哮喘者为MP-非哮喘组。无菌采集静脉血2ml,进行基因组DNA提取,采用Fluidigm Juno 96.96 Genotyping 集成流体通路(Integrated Fluidic Circuit,IFC)系统对ORMDL3、HLA-DQ基因4个SNPs位点进行基因分型。采用SPSS19.0软件进行统计分析。采用广义多因子降维法(generalized multifactor dimensionality reduction,GMDR)分析基因-基因交互作用。结果:200例MP感染住院患儿,失访6例,最后纳入研究194例,其中男性患儿136例,女性患儿58例,男女患儿比例约为2.3:1;年龄为3~11岁,平均年龄(6.23±2.01)岁。MP-哮喘组 63 例,比例为 32.5%(63/194),MP-非哮喘组 131例。ORMDL3基因rs4794820位点存在AG、GG、从3种基因型,MP-哮喘组的GG纯合子基因型和G等位基因频率高于MP-非哮喘组(分别为60.3%和42.7%,78.8%和61.8%,P<0.05),两组间均以AA纯合子基因型频率最低,但在MP-非哮喘组高于MP-哮喘组(分别为19.1%和4.8%,P<0.05);rs7216389位点存在TT、TC、CC3种基因型,MP-哮喘组的TT纯合子基因型和T等位基因频率明显高于MP-非哮喘组(分别为65.1%和45.0%,79.4%和64.5%,P<0.01),两组间均以CC纯合子基因型频率最低,但在MP-非哮喘组明显高于MP-哮喘组(分别为16.0%和6.3%,P<0.01)。rs4794820位点GG基因型、rs7216389位点TT基因型危险度分析发现,两基因型均为危险因素(分别为OR=2.036,95%CI=1.104~3.754,χ2=5.258,P=0.012;OR=2.274,95%CI=1.221~4.236,χ2=6.841,P=0.009)。HLA-DQA1 基因 rs9272346 位点存在 AG、GG、AA 3种基因型,HLA-DQA2 rs7773955位点存在TT、TC、CC 3种基因型,但两位点的等位基因和基因型频率在MP-哮喘组和MP-非哮喘组间分布差异无统计学意义(P>0.05)。ORMDL3与HLA-DQA1、HLA-DQA2基因在儿童MP感染相关哮喘中存在基因-基因交互作用(交叉验证一致性为10/10,检验准确度为0.6617,符号检验P=0.0107)。最优模型为 ORMDL3rs4794820、rs7216389 和 HLA-DQA1 rs9272346 三个基因位点的联合作用模型(交叉验证一致性为10/10,检验准确度为0.6783,符号检验P=0.0010)。另外ORMDL3 rs4794820、rs7216389两个位点间也存在较强的协同作用(交叉验证一致性为10/10,检验准确度为0.6682,符号检验P=0.0010)。结论:MP感染是儿童哮喘发生的重要外因。有过敏性疾病史及哮喘家族史的MP感染患儿更易引发哮喘。ORMDL3基因rs4794820位点GG基因型,rs7216389位点TT基因型是儿童MP感染后引发哮喘的危险因素,rs4794820位点AA基因型,rs7216389位点CC基因型可能是其保护因素。未发现HLA-DQA1 rs9272346和HLA-DQA2 rs7773955位点单核苷酸多态性在MP-哮喘组与MP-非哮喘组患儿之间有分布差异。ORMDL3与HLA-DQA1、HLA-DQA2基因在儿童MP感染相关哮喘中存在基因-基因交互作用,它们的这种交互作用可能对儿童MP感染相关哮喘的发生具有累计效应。