县域产业结构是县域发展程度高低的重要标志,是社会公众对一个县市在经济上的认肯,在实现经济社会环境协调发展战略目标的过程中发挥着极其重要的支撑作用。改革开放以来,晋江产业实现了飞跃发展,使晋江经济连续十几年位居福建县域经济实力“十强县市之首”,成为福建县域经济发展的“领头羊”,然而晋江市依靠低成本要素支撑的产业发展模式已难以为继,同时,在国际产业高层次化、产品呈现科技含量高密化的发展趋势下,劳动力、自然资源等传统要素对产业结构的贡献已呈现递减趋势,科技创新的重要性正明显上升,这使得科技创新成为产业结构优化升级的现实选择。此外,“十二五”时期正是晋江由数量扩张到素质提高的关键转型时期,此时提出依靠科技创新促进产业结构优化升级正值要时,因此,探讨科技创新促进晋江市产业结构优化升级意义重大且迫在眉睫。本文在分析晋江市产业结构现状、问题及解决关键的基础上,认为科技创新是产业结构优化升级的关键,并从理论角度阐述科技创新促进产业结构优化升级的作用机理,从实证角度上运用协整和格兰杰因果关系检验分析方法对科技创新如何促进晋江市产业结构优化升级进行评价,最后根据理论分析和实证分析的结果,提出依靠科技创新促进晋江市产业结构优化升级的建议。研究结果表明：(1)晋江市在产业结构优化升级方面取得良好的成绩,但也存在着三次产业结构比例不尽合理、产业结构层次仍然低度化、工业企业规模实力不够强、第三产业内部结构水平较低等产业结构问题。本文认为解决问题的关键就在于依靠科技创新。(2)理论上,科技创新对产业结构优化升级的作用机理：一是推动作用,科技创新通过改变要素供给结构推动产业结构优化升级、科技创新通过加速产业改造升级推动产业结构优化升级；二是拉动作用,科技创新通过改变需求结构拉动产业结构优化升级、科技创新通过改善进出口结构拉动产业结构优化升级。(3)实证上,科技创新促进晋江市产业结构优化升级主要体现在：第一,根据最小二乘法估计协整模型,科技创新与晋江市产业结构优化升级之间具有正向的相关关系。第二,根据格兰杰因果关系检验结果,2年内科技创新是晋江市产业结构优化升级的格兰杰原因,即增加科技创新投入对晋江市产业结构优化升级具有正向的促进作用。(4)理论和实证的结果加强了必须依靠科技创新促进晋江市产业结构优化升级的结论。其实现途径包括依靠科技创新推进工业结构、服务业结构、农业结构的优化升级。