鸡传染性法氏囊病病毒Ts毒株基因组B片段的克隆与序列分析

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用鸡胚成纤维细胞繁殖鸡传染性法氏囊病病毒(IBDV)Ts毒株,提纯的病毒颗粒提取基 因组dsRNA.根据已报道的加拿大OH株序列设计引物,用RT-PCR进行cDNA扩增,获得976bp、774bp和997bp的三个部分重叠的片段,分别克隆于pGEM-Teasy载体,利用SP<,6>,T<,7>特 异引物及PCR引物进行序列分析,并连接为一个完整的大片段.结果表明,所克隆片段为2665bp的IBDVVP<,1>基因的大开放读框.与已报道的多个IBDV毒株相应序列比较后发现,核苷 酸同源性介于87﹪~99﹪,推导的氨基酸序列同源性介于91﹪~96﹪之间.由强毒株Ts与疫苗弱毒株2512的核苷酸及氨基酸序列均表现最高同源性、OH毒株100~135位氨基酸出现连续的移码突变似乎表明:B片段并非影响IBDV毒力的强弱,而是决定毒力的有无.与同科鱼传 染性胰脏坏死病毒DRT毒株VP<,1>的氨基酸序列同源性仅为42.5﹪.尽管Ts株与DRT株的整体同源性很低,但在VP<,1>蛋白的中部仍发现有高同源区段.在两种病毒中均发现与GTP结合 蛋白、依赖于RNA的RNA聚合酶(RdRp)相关的保守序列.然而,与单链RNA病毒不同的是:作 为RdRp家族特征的G-D-D序列在两种病毒中都未发现.
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