【摘 要】
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本文使用PCR扩增方法得到泽鳄（Crocodylus palustris）和菲律宾鳄（Crocodylus mindorensis）的线粒体基因组全序列,其序列全长分别17, 052 bp和16, 939 bp,与其他鳄类的线粒体基因
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本文使用PCR扩增方法得到泽鳄（Crocodylus palustris）和菲律宾鳄（Crocodylus mindorensis）的线粒体基因组全序列,其序列全长分别17, 052 bp和16, 939 bp,与其他鳄类的线粒体基因组基因组成和排列相一致,相比于典型的脊椎动物线粒体而言,仅出现了两个tRNA基因重排,即tRNAPhe转移到tRNAPro的3’端,同时tRNASer（AGY）和tRNAHis基因的位置发生了互换。基于12个位于重链上的蛋白质编码基因序列,运用最大似然法和贝叶斯法构建系统树,探讨了14种线粒体基因组全序列已被测定的鳄类的系统发生关系。研究结果支持现存鳄目聚为两支,即鼍科和鳄科,建议将传统的食鱼鳄科食鱼鳄并入鳄科,并作为鳄科中的一个属,与假食鱼鳄属构成姐妹群关系,非洲窄吻鳄与非洲侏儒鳄的亲缘关系最近,独立于鳄属的主支,因此,鳄科内的属间亲缘关系可以表示为（（食鱼鳄属+假食鱼鳄属）+（鳄属+（长吻鳄属+骨喉鳄属）））。而侏儒凯门鳄属与凯门鳄属构成姐妹群,隶属鼍科。另外,本文对鳄属内的种间关系也进行了讨论。
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