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民以食为天,人们生活中不可缺少的饮食,是影响肠道菌群的重要因素之一。合理健康的膳食能够营造肠道菌群的健康环境、提升机体肠道有益菌含量、提高宿主健康和预防疾病,是调节肠道菌群最为经济的手段,因此了解膳食对肠道菌群的影响十分重要。近些年,针对膳食因素对宿主肠道菌群影响的研究越来越多,而针对主食对肠道菌群研究很少,因此本研究的开展为探究膳食对肠道菌群的影响具有重要意义。本试验参照我国膳食特点,选取具有民族饮食特点和独特肠道菌群结构的蒙古国志愿者为对象进行连续三周主食变换的膳食摄入。试验期间,以7天为一个周期变换一次主食,第1周主食为小麦粉、第2周主食为稻米和第3周主食为莜面。综合应用能精确测定到种水平的三代测序技术和shotgun宏基因组测序技术研究主食变换对肠道菌群结构和功能的动态影响。结果如下:三代测序对志愿者菌群结构分析结果表明:Firmicutes、Bacteroidetes、Tenericutes和Proteobacteria是志愿者肠道中的主要菌门,而且从科水平开始志愿者肠道菌群个体差异明显。小麦粉、稻米和莜面三种主食的膳食摄入影响志愿者肠道菌群结构,降低肠道菌群丰度和多样性,显著影响以Bacteroidaceae为主要菌群志愿者的肠道菌群结构(p<0.05)。主食变换期间,志愿者肠道中与碳水化合物代谢相关及SCFAs代谢相关的菌种含量发生显著变化,其中食用莜面时Ruminococcus albus含量显著高出食用小麦粉时的3.06倍;而且Bacteroides fragilis和Roseburia的含量分别是主食变换前的5.00倍和4.04倍。Shotgun宏基因组测序结果表明:三周主食变换能够快速改变肠道菌群结构及功能,其中食用小麦粉和莜面能够提高肠道中bifidobacteria(Bifidobacterium catenulatum、Bifodobacterium bifidum 和 Bifidobacterium adolescentis)的含量。主食变换能够提高肠道菌群碳水化合物代谢能力,食用稻米后肠道菌群丁酸代谢途径显著增加。主食变换期间,肠道菌群、碳水化合物酶及碳水化合物具有紧密相关性,Lactobacillus ruminis与唾液酸酶有相关性,而且Butyrivibrio crossotus与木聚糖酶和木糖苷酶有相关性。肠道噬菌体组与肠道细菌的协同作用分析表明,主食变换时肠道细菌与噬菌体参与代谢的协同一致性。本研究综合应用能测定到种水平的三代测序技术及shotgun宏基因组测序技术,首次以主食变换角度分析了膳食对肠道菌群的影响。本研究的开展为深入探究膳食对肠道菌群的影响提供了理论依据,也为进一步分析膳食、肠道菌群及人体健康之间的关系提供了新方法和新思路。