基于对国外园区的参考，在政府优惠政策下，我国仿效硅谷等发展模式于1991年起先后建立了53个国家级高新区，发展高新区是我国实施科教兴国、科技创新战略的重要内容。然而我国的高新区同硅谷等园区相比，出现了创新绩效不足的现象，为了找出原因，现阶段国家高新区提出了“二次”创业，进一步提升、整合资源，为此，对高新区产业集聚情况的测度、创新绩效的评价迫在眉睫。 产业集聚是随着经济发展产生的经济现象，这种大量企业和相关机构在一定区域的集聚，一方面使产业群平均成本下降，另一方面又使集群中单个企业的平均成本下降，形成产业群的无形资产。随着区域产业的集聚，特定区域通过无形资产存量的变化，促使区域的创新绩效的提高。本文把高新区作为研究对象，试图从理论和实证分析两个层面展开研究。国家高新区产业聚集度，主要反映园区内的各产业相关企业数量、规模聚集的程度。高新区创新体系的创新绩效就是该创新体系在创新方面所取得的成绩，它取决于高新区对现有创新资源配置能力的绩效，是资源状况与配置力相综合的结果。结合中国高新区发展的具体情况，基于产业集聚研究区域创新，构建高新技术产业集聚因素提升高新区创新绩效的理论模型，揭示高新区发展的内在机理，基于产业集群的知识资本、组织资本具有植根性，这种植根性决定产业集群的知识资本、组织资本是难以模仿的，从而形成产业集群的独特竞争优势，进而推动整个区域的创新绩效的提高，提出基于产业集群的知识资本、组织资本是创新绩效的影响因素，进而提出产业集聚因素是不同于研发经费投入和研发人员投入的知识生产函数中的另一个主要因素，即影响着创新绩效的提升。构建高新技术产业集聚提升高新区创新绩效的实证分析模型，采用集聚度指标对高新区的集聚程度进行测度，以全国53个高新区为例，采用面板数据进行计量经济学的回归分析，分析产业集聚作用的发挥，结果表明产业集聚对高新区创新绩效的提高具有放大作用。并且提出进一步发展高新区、提高其创新绩效的对策建议。