独立学院作为我国高等教育改革创新的一种新模式,虽然仅有十年的历史,但其发展速度和对我国高等教育大众化进程的贡献却是有目共睹的。独立学院在我国高等教育中占据独特的地位,并呈现出良好的发展态势。教育部第26号令的颁布,对独立学院提出了更高的要求,对其既是一次机遇,更是一次挑战,预示着独立学院将进入规范发展阶段。有效的治理结构是独立学院规范发展的前提条件。然而,目前独立学院治理结构较混乱,没有现成的模式可参考,与现实的要求也差距较大。因此,加强对独立学院治理结构的研究非常必要。从独立学院的产生和发展、办学目标、投资结构和风险承担等角度看,独立学院是一个典型的利益相关者组织。不同时期,独立学院利益结构中各利益相关者的影响力也不相同,不同的影响力将会导致不同的治理结构,到目前为止独立学院治理结构发展大致经过三个阶段,但每个发展阶段很难能严格界定划分,当前独立学院治理结构呈现多元性、复杂性特点,存在着产权模糊、各利益相关者关系混乱等多方面问题。要解决这些问题,必须遵循公益性、动态性、共性与个性相结合的原则,理清各利益相关者之间的关系,并随时代和环境变化不断调整和完善,要特别重视校友资源的开发、利用和管理,构建一个各利益相关者代表共同治理、利益和权利均衡配置的治理模式。