高肩金线鲃(Sinocyclocheilus altishoulderus)与滇池金线鲃(Sinocyclocheilus grahami)线粒体DNA全序列比较分析

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本研究对高肩金线鲃和滇池金线鲃线粒体DNA全序列进行了测定,统计了线粒体DNA的碱基组成、密码子使用频率,模拟tRNA的二级结构,分析两个物种之间的共同点与差异,并将金线鲃线粒体DNA与鲤(Cyprinuscarpio)、鲫(Carassiusauratusauratus)、鸡(Gallusgallus)和人(Homosapiens)的进行比较,得出以下结果:   1.高肩金线鲃线粒体基因组总长度为16586bp,滇池金线鲃线粒体总长度为16585bp,它们的长度与鲤科其他鱼类相似。   2.2种金线鲃的线粒体DNA和其他脊椎动物的一样包含13个蛋白质编码基因,2个rRNA基因、22个tRNA基因和一个主要的非编码区(控制区)。   3.高肩金线鲃和滇池金线鲃之间的遗传距离为9.67%±0.0027。   4.在密码子的使用频率上,两个物种有基本相同的偏倚模式,并且和已经研究的其他脊椎动物相同。2种金线鲃蛋白质编码基因起始密码子均相同,终止密码子除ATP8的以外,其他的都相同。   5.高肩金线鲃和滇池金线鲃线粒体基因中的D-loop区、ND基因、ATP基因和Cytb基因的变异较高,COX基因、rRNA基因和tRNA基因的变异相对较低。   
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