2009年10月30日，创业板市场首批28家上市公司在深圳交易所正式挂牌交易，标志着我国创业板时代正式来临。与主板市场相比，创业板市场在上市企业规模、行业分布、投资者结构、退市制度等方面存在较大的区别，但两个市场均属于我国多层次证券市场的一部分，都要面临一些共同的影响因素，那么两个市场的走势是否相关，如果存在相关，那么在不同情形下相关程度如何，比如在暴跌或暴涨的情形下相关程度是否提高，这种“尾部相关性”，对于投资者和风险管理者是一个至关重要的问题。因此，本文对主板和创业板之间的相关结构进行深入研究。本文采用Copula函数技术对两个市场的相关结构进行分析，并且结合风险价值VaR进行风险预测能力分析。首先，本文分析了我国主板和创业板市场收益率各自的分布特征。在Q-Q图等检验基础上，通过对风险价值VaR的预测能力进行比较，发现GARCH-Normal模型不能很好的捕捉创业板市场的尾部特征，而较好的模型为GARCH-T模型。但在主板市场上，相比GARCH-T模型，简单的GARCH-Normal能够更准确的捕捉尾部特征。即与主板市场相比，创业板市场存在更厚的尾部。其次，在对主板和创业板市场收益率分布特征有效估计的基础上，对不同Copula函数进行估计。通过检验发现，混合Copula模型更适合用来描述我国主板和创业板市场之间的相关结构，两个市场之间整体具有正相关关系，但存在非对称的尾部相关，即两个市场在暴涨或暴跌的情况下，相关程度明显提高，并且在暴跌时的相关程度高于暴涨时的相关程度。并在Copula基础下，利用蒙特卡洛模拟方法对投资组合的VaR进行分析，发现无论在样本内还是样本外混合Copula的风险预测效果最优。