甘氨酸(GLY)作为最简单的蛋白质结构单元和重要的生命营养物质,在生命体系中扮演着十分重要的角色,因而探讨甘氨酸与水分子之间的相互作用具有非常重要的意义。本论文应用原子-键电负性均衡方法融合进浮动电荷分子力场(ABEEM/MM)的模型和方法,编制和调试有关程序,构建了一个新的GLY-水势能函数,并将其应用到气相团簇GLY(H2O)n(n=1-8)的研究中。文中对研究体系均采用B3LYP/6-311++G(d,p)方法进行结构优化和频率计算,在MP2/6-311++G(3d,3p)水平上对构象进行能量计算,对GLY-水团簇的能量计算同时进行了BSSE校正。通过对团簇GLY(H2O)n(1-3)采用ABEEM/MM进行各种性质的模拟并与从头算的计算结果进行比较,拟合一套理想的GLY-水势能模型参数,并将参数在毫无修改的情况下,直接转移到团簇GLY(H2O)n(4-8)的计算中,与从头计算相比同样得到了比较理想的结果。首先研究了GLY单体的几何构型,构型结果与可获得的实验数据显示了很好的一致性;根据对GLY中氮原子和氧原子以及它们的孤对电子的电荷分布的ABEEM/MM方法分析,可以解释水与作用点形成氢键的强弱。继而应用此模型研究了团簇GLY(H2O)n(n=1-3)的性质,包括优化的几何构型、偶极矩、ABEEM电荷分布、相互作用能以及氢键的协同效应等。这些研究结果与可获得的实验数据和从头计算结果相比,都显示了很好的一致性。为了验证我们的GLY-水势能模型的合理性以及参数的正确性和可转移性,我们研究了较大的GLY-水复合体系GLY(H2O)n(n=4-8)的一些性质,包括优化的几何构型、团簇的相互作用能和连续结合能。这些研究结果与从头计算方法相比也显示了很好的一致性。