影响基因组密码子使用的因素分析

来源 :中国农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hamkang
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链球菌属肺炎球菌(S.pneumoniae)与耶尔氏鼠疫杆菌(Y.pestis)是两种重要的致病微生物,其完整基因组序列已于2001年被测定并发表.针对基因组中各个基因的表达水平、基因长度、密码子使用偏移程序、基因组组成、基因组成、基因的GC3s、A3s、T3s、G3s、C3s、Nc等指标,应用多元统计分析的方法,对两个基因组中所有长度大于或者等于300bp的基因的密码子使用模式以及影响密码子使用变异的因素进行分析.由于密码子使用与基因多态性的密切关系,利用脊椎动物(鸡)主要组织相容性复合体(MHC)多态性数据进行了密码子使用分析,同时对特定的MHC单倍型与抗病性状的关系进行了研究.
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