中小微企业对我国经济发展水平的影响非常显著,它有利于国内生产总值的提高,就业水平的改善,科学技术的创新以及人类社会的稳定。但是中小企业自身质量较差、银行信贷配给不合理、资本市场体系不完善等因素造成了中小企业融资困难的局面,使之成为阻碍中小企业健康发展的主要障碍。随着新三板市场的建立以及快速成长,我国中小企业的融资困境在一定程度上有所改善,其拓宽了中小企业的融资渠道,成为中小企业融资的重要平台。新三板分层制度的实施有利于对挂牌企业实行分类服务、分层监管,满足处于不同发展阶段的中小企业的差异化需求,实现资源的优化配置,同时也降低了投资者收集信息及做出投资决策的难度,以及中小企业的融资风险和融资成本,该制度是完善新三板市场制度和促进新三板市场健康发展的一项重大改革措施。鉴于此,探究新三板企业分层前后的效率改进情况和政策实施效果是极具价值的。本文基于三阶段DEA模型对新三板挂牌企业的融资效率进行测度,克服了传统DEA模型的缺陷,利用SFA模型剥离了环境因素和随机因素的影响,对新三板企业的融资效率作出更为准确的测算。根据三阶段DEA模型的测算结果,将第一阶段和第三阶段的融资效率水平进行对比分析,并将新三板企业2015-2017年各类效率值进行纵向比较,以此来探究剔除环境因素影响后新三板企业分层前后的融资效率问题。实证结果表明,环境因素的确对样本企业的融资效率产生了比较显著的影响,剥离环境因素影响之后的第三阶段DEA模型测算结果能够更加准确的反映新三板企业的整体融资效果,环境因素使得样本企业的纯技术效率水平被低估,规模效率水平被高估,从而使得新三板企业整体的技术效率水平存在估计误差。新三板市场分层制度在一定程度上提高了挂牌企业的融资效率,综合技术效率水平、纯技术效率水平和规模效率水平都得到了不同程度的提升,其中规模效率水平的改善情况更加明显,但是整体融资效率水平依然低下,大部分企业的融资效率都处于相对较无效和相对无效状态,规模效率不足是制约新三板挂牌企业融资效率提升的主要原因。