扬州市先天性聋儿耳聋基因的筛查研究和遗传性耳聋胚胎植前遗传学诊断技术的建立

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研究背景:遗传性耳聋是人类最常见的感觉障碍,发病率高达1/1000。是造成人类残疾最常见的疾病。人类30%的感觉信息来自于听觉,因此听力障碍严重影响人类的生活质量。对儿童早期言语的习得造成严重影响。2006年中国第二次全国抽样调查统计的听力言语残疾人数为2780万人,占残疾人总数的33.52%,且每年新增人数达30000人。值得注意的是,所有致病因素中遗传因素占50%,其中70%为非综合性聋,30%为综合性聋。综合性聋与非综合性耳聋可进一步分为常染色体显性遗传、常染色体隐性遗传,性连锁遗传,线粒体遗传和复合型遗传。致病基因位于染色体上,通过遗传传递给子代。大量的文献报道表明,主要致病基因型是:GJB2,SLC26A4,mtDNA12S rRNA,GJB3。线粒体12SrRNA1555A>G、1494C>T,GJB2基因35delG、167delT、176_191del16、235delC、299_300delAT,GJB3基因538C>T、547G>A,SLC26A4(PDS)基因281C>T、589G>A、IVS7-2A>G、1174A>T、1226G>A、1229C>T、IVS15+5G>A、1975G>C、2027T>A、2162C>T、2168A>G均为突变热点。本研究中,通过对患儿致病基因的筛查,在对单个细胞进行单核苷酸多态性检测的基础上,利用全基因组扩增(WGA)和聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(RFLP)方法,建立起胚胎植入前遗传学诊断(PGD)技术。研究表明,利用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性技术检测单细胞IVF周期的基因型是有效。  第一部分扬州市先天性聋儿耳聋基因的筛查研究  目的:应用基因芯片技术对扬州市97例先天性聋儿进行基因筛查,明确致病基因型,以达到预防和减少先天性聋儿出生率的目的。  方法:所有患者均确诊为非综合性耳聋,均来自扬州市特殊教育学校,并签署知情同意书。男50例,女47例,年龄7-18岁。采用外周静脉血3ml行DNA检测,通过扩增、杂交及洗涤等聚合酶链反应(PCR)检测耳聋基因型。通过基因检测和分析共获得4个基因型9个突变位点:GJB2(35delG,176del16bp,235delC,299_300delAT),GJB3(538C>T,547G>A, SLC26A4(IVS7-2A>G,2168A>G)和mtDNA12SrRNA(A1555G。  结果:50.51%的患者携有突变基因,其中GJB229.90%,SLC26A419.59%,mtDNA12SrRNA1.03%,未发现GJB3。18例纯合子突变:12例GJB2,5例SLC26A4,1例mtDNA12SrRNA,杂合子突变31例:17例GJB2,14例SLC26A4;复合杂合子突变7例:3例GJB2,4例SLC26A4。  结论:扬州市遗传性耳聋发病率较高,GJB2是主要致病基因,且SLC264A基因型的突变率高于全国平均水平,本研究为耳聋基因的早期临床预防和干预提供了科学依据。  第二部分遗传性耳聋胚胎植入前遗传学诊断(PGD)技术的建立  目的:本次研究的主要目是通过对单个细胞进行单核苷酸多态性检测,利用全基因组扩增(WGA)和聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(RFLP)方法,建立遗传性耳聋的胚胎植入前遗传学诊断(PGD)技术,进一步分析其影响因素,了解中国人群的遗传规律,以提高对先天性耳聋疾病的诊断、预防和康复治疗。  方法:收集20个来自扬州苏北人民医院生殖中心的废弃胚胎样本,应用透明切割技术对6-10期的受精卵细胞行卵裂球活检。利用全基因组扩增(WGA)和聚合酶链反应邛艮制性片段长度多态性(RFLP)技术制备单细胞基因模板,对单卵裂球中最常见的突变基因进行PCR扩增,限制性内切酶进行酶切,发现GJB2(235delC)和12SrRNA(1555A>G)基因型是中国人群遗传性耳聋疾病的主要致病基因。  结果:20例废弃胚胎样本均行全基因组扩增(WGA),均获得单卵裂球。经扩增后20例获得12S rRNA基因,10例获得GJB2基因。酶切扩增产物:GJB2(844bp)切割成长链(511bp)和短链(333bp),12SrRNA(463bp)切割成长链(339bp)和短链(124bp)。同时测序结果表明:限制性内切酶ApaⅠ切割GJB2获得黏性末端“GGGCCC”,限制性内切酶BsmaI切割12S rRNA获得黏性末端“GAGAC”。CYP2B6最终采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法进行测定。  结论:本次研究首次应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性技术对遗传性耳聋基因进行测定,结果表明对IVF同样适用。全基因组扩增(WGA)与聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(RFLP)方法的结合应用,提供了一种快速、灵敏、准确的方法来早期检测胚胎是否携带耳聋致病基因,以便早期临床干预。
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