作为我国的重要税收改革,营改增对我国增值税制改革有重大意义。增值税制度有两个主要特点:一是征税范围广,税负公平;二是不重复征税,环环相扣。然而要确实实现增值税的公平和中性原则,需要横向和纵向税收抵扣链条的完整。2004年我国从生产型到消费型转变的增值税制转变已逐步完成,实现了纵向链条的抵扣。如今营业税向增值税改革是对横向抵扣链条的完善。在营改增这项改革的设计和实施中,中小企业成为了不容忽视的重要群体。新疆的中小企业发展迅速,在新疆社会发展中的地位和作用日益增强,其发展速度直接影响着区域经济的整体增长速度。可以说中小企业已经成为新疆经济发展的生力军,其在产业结构调整、产品技术创新、解决城镇就业和农村劳动力转移等方面发挥着日益重要的作用,是促进新疆社会稳定发展的一支基础力量。本文以新疆中小企业为研究对象,研究营改增对新疆中小企业的影响,以及如何有助于解决中小企业融资难、治理结构不合理、生产技术水平低、竞争力不强等问题。文章首先对“中小企业”和营改增等重要概念进行内涵及外延的阐释,并梳理了相关理论基础;其次通过分析新疆中小企业的发展现状,选取交通运输、广告服务业、验证咨询服务业中的六个典型企业为案例实证分析了营改增对新疆中小企业的影响;最后通过分析当前营改增制度中的缺陷提出促进新疆中小企业发展的政策思考。通过研究发现目前我国营改增制度主要存在以下缺陷:一是,部分税率设计不合理;二是,中小企业不能有效的利用营改增带来的正面效应。同时本文提出了促进新疆中小企业发展的税收政策思考,主要有:(1)新疆中小企业应扩大成本中可扣除陈本比例;(2)完善税率结构,适当降低税负;(3)提高中小企业对发票会计核算等税务管理的水平