大肠杆菌DXS关键氨基酸残基的研究

来源 :西北大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:chunhuac
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
2-甲基-D-赤藻糖醇-4-磷酸(MEP)途径是大多数微生物(包括人类致病菌)体内萜类化合物的唯一来源,而人体内并不存在该途径。因此,MEP途径被认为是寻找新的抗菌化合物的理想靶标。1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合酶(DXS)催化的1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸(DXP)合成反应被认为是MEP途径的限速步骤,也与细菌及植物中萜类化合物的最终含量密切相关,同时它又是某些微生物中硫胺素(Vitamin B1)和磷酸吡哆醇(Vitamin B6)这两个具有重要生理功能的化合物生物合成途径中的关键酶。因此,DXS在这三条途径中都发挥着重要的作用。目前对DXS催化机理的研究甚少,为了进一步了解DXS催化机理,对DXS活性位点的关键氨基酸残基进行研究极为必要。基于晶体学和分子对接分析,我们探究了大肠杆菌DXS中可能与催化活性相关的关键氨基酸残基,分别为Ser44、His49、Arg99、 Lys101、Val259、Tyr392、Arg420、Asp427、Arg478。首先通过定点突变技术获取突变基因,再将携带突变基因的质粒转化到大肠杆菌BL21DE(3)感受态细胞中,然后用IPTG诱导表达、纯化,得到十种突变体酶,它们分别是S44D-DXS、H49Q-DXS、 R99N-DXS、K101D-DXS、V259E-DXS、Y392K-DXS、R420N-DXS、D427K-DXS、 D427N-DXS、R478E-DXS。通过酶联紫外法测定了DXS突变体的活性及稳态动力学参数,并将它们与野生型DXS(WT-DXS)的稳态动力学参数进行比较。研究结果表明:S44D的突变导致DXS催化活性丧失,S44D-DXS的活性仅为WT-DXS的0.58%;H49Q、K101D、Y392K和D427K的突变对DXS催化活性有非常显著的影响,这些突变体酶的催化活性分别是WT-DXS的4.98%、8.97%、8.15%和8.73%;R99、R420N和D427N的突变对DXS催化活性也存在较显著的影响,酶活性分别是WT-DXS的27.78%、19.17%和52.75%;而259位的缬氨酸残基对DXS的催化活性无显著影响,V259E-DXS的活性是WT-DXS的84.04%。当我们用亚硝基苯来替代DXS的天然底物D-甘油醛-3-磷酸(D-GAP)时,S44D-DXS、H49Q-DXS、R99N-DXS、K101D-DXS、D427N-DXS、 R478E-DXS催化C-N键形成的活性不受影响,而Y392K-DXS、D427K-DXS催化活性显著降低。本研究有助于更深入的了解DXS的催化机理,为新型抗菌药和抗疟药的筛选提供了合理的依据。
其他文献
差分方程组的定性理论研究在应用数学、经济学与生物数学等研究领域具有重要的作用.差分方程组的解及解的稳定性、渐近性、周期性或振动性等性质的研究是差分方程定性理论研
椭圆偏微分方程解的水平集凸性一直是人们关注的重要话题.本文利用椭圆偏微分方程的极值原理,对一类椭圆偏微分方程解的水平集曲率给予刻画.文章主要分为三个部分:第一部分引
人体正常左右冠状动脉分别从左右冠状窦发出,然而有时会出现冠状动脉起源异常的现象。先天性冠状动脉起源异常(coronary artery anomalies,CCA),是一组先天性冠状动脉疾病的总称,右冠状动脉异常起源于左冠状窦(AORL)是冠状动脉起源异常的一种。先天性冠状动脉异常在临床上很少见,绝大多数患者是无临床症状的,但仍有少数患者会有心肌缺血、心肌梗死、甚至猝死等临床症状。近年来,研究人员
非线性泛函分析是应用数学中具有深刻理论和广泛应用的研究学科,以数学和自然科学中出现的非线性问题为背景,建立了处理非线性问题的若干一般性理论和方法.本文共分为两章,第
秦岭川金丝猴主要是由两种基本单元组成基层组织构成的重层社会结构,基层组织由一雄多雌单元(One-Male Unit,OMU)与全雄单元(All-Male Unit,AMU)构成。研究中发现,在OMU中也
嵌合抗原受体修饰T淋巴细胞(Chimeric antigen receptor modified T lymphocyte,CAR-T)疗法在血液系统恶性肿瘤中已取得了突破性进展,然而,CAR-T在实体瘤治疗中仍面临巨大挑
马尼塔石英闪长岩其位置处于内蒙古自治区西乌珠穆沁旗东北部,大地构造位置上处在兴蒙造山带东段贺根山缝合带内,该区域构造、岩浆活动强烈,蛇绿岩断续出露。本文对马尼塔石英闪长岩进行了野外地质勘察,对其岩石学、地球化学、年代学等进行研究,总结了其岩石学与地球化学特点,探讨了该石英闪长岩的形成原因和大地构造背景,为古亚洲洋东段二连浩特—贺根山洋盆的扩张时间和俯冲、消减具体进程提供了岩石学证据与时间约束。马尼
背景与目的:糖鞘脂是一类普遍存在于生物细胞膜表面的生物活性脂质,它在细胞识别、细胞间信号转导、影响细胞迁移能力和肿瘤血管生成等方面起到了至关重要的生物学作用。由于
蛹虫草作为虫草属模式种,地理分布广泛,是研究子囊菌虫生真菌遗传的代表性物种。因此,研究蛹虫草的多样性及多态性、交配系统等具有重要意义。本研究利用采自不同地区蛹虫草种质资源开展研究,得到以下结果:1.通过对蛹虫草的多样性与多态性分析,采用对不同地区的样品进行形态学观察及多基因联合聚类方法,确定不同来源的蛹虫草多样性。其中,18个地区样品的序列与蛹虫草数据库信息比对具有较高同源性确定其均为蛹虫草。同时
云和云阴影的高精度检测对光学卫星数据的应用具有重要的意义。由于光谱信息和纹理特征的显著差异,云的识别可以达到相对较高的精度,而因为受到地表结构复杂性和不同云类型的影响,导致云阴影的识别普遍较为困难。与传统的方法相比,深度学习算法可以较好的识别图像中的云阴影,但因为对大量学习样本的需求,该方法通常难以在不同传感器中推广应用。本文提出一种高光谱样本数据集支持的深度学习云阴影检测算法。该方法通过航空高光