福州地区急性下呼吸道感染住院儿童病毒病原的检测及呼吸道合胞病毒分析

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目的1.研究福州地区急性下呼吸道感染(ALTRI)住院儿童呼吸道病毒病原谱的构成及其流行规律,为感染儿童的临床诊疗提供有价值的流行病学资料。2.了解福州地区急性下呼吸道感染儿童中呼吸道合胞病毒(Respiratory syncytial virus RSV)的优势亚型和流行株基因型变异特征,预测下一个流行季节的优势亚型和基因型,为RSV防控及其抗病毒药物和相关疫苗的研制提供新的有用信息。方法连续采集2018年1月至2019年1月福建两家医院因急性下呼吸道疾病住院儿童患者鼻咽部的分泌物标本,用直接免疫荧光法对采集的标本进行RSV、甲型流感病毒(Influenza A virus IFVA)、乙型流感病毒(Influenza B virus IFVB)、腺病毒(Human adenovirus HAdV)、副流感病毒1型(Parainfluenza virus type1,PIV1)、副流感病毒2型(Parainfluenza virustype 2,PIV2)和副流感病毒3型(Parainfluenza virus type 3,PIV3)七项抗原进行检测。随机选取七项检测中RSV阳性样本进行细胞培养,观察细胞病变效应。随机抽取2018年1月至2019年1月期间56例RSV阳性标本,采用PCR和Sanger测序对RSV G蛋白基因C-末端第二个高变区(the second highly variable region HVR2)进行测序,用DNAMAN软件比对多序列,计算同源性,用MEGA7.0软件测算相关的遗传距离并构建基因进化树,分析RSV的亚型的变化特点。通过重点检测2018年1月至2019年1月急性下呼吸道感染患儿感染病毒病原体的流行特征并结合近两年的流行情况,分析福州地区呼吸道病毒的连续性变化。结果2018年1月至2019年1月共收集急性下呼吸道住院儿童鼻咽拭子标本2435例,检出阳性标本487例(20.0%)。阳性标本中包括RSV 392例、IFVA 37例、IFVB 4例、HAdV 37例、PIV1 3例、PIV2 4例和PIV3 19例,其中RSV在所有阳性标本中的比例是80.5%,为主要感染病毒病原。在病毒阳性的487例患儿中共有复合感染患儿9例(1.8%),(RSV+HAdV)2例、(RSV+IFVA)2例、(RSV+IFVB)3例、(RSV+PIV2)1例、(RSV+PIV3)1例。患儿病毒感染的年龄大多数小于2岁。2018年1月到2019年1月各月均有检出阳性标本且均以RSV感染为主(感染率为16.1%)。感染的季节主要在冬春季,在2018年3月和2018年12月各出现一次高峰。2018年12月RSV在各月所有病人感染率中达到最高值(27.3%),2018年7月感染率最低。其次是IFVA在2019年1月出现一个小的高峰期。进行细胞培养,显微镜下观察到Hep-2细胞经病毒感染后产生的细胞病变效应。随机抽取56例RSV阳性标本进行PCR扩增并测序分析,电泳结果有目的条带的标本45例,其中A亚型32例(65.3%),B亚型12例(21.4%)。将A、B亚型G基因扩增产物进行双向核苷酸序列测定并分析。32株A亚型分离株(除单独一支的FZ32609外)核苷酸同源性为87.8%-100%,氨基酸同源性为83.5%-100%,32株RSV A亚型分离株中有30株(93.8%)基因型属于ON1型。12株B亚型中的9株(75%)属于BA11基因型。核苷酸同源性为97.9%-100%,氨基酸的同源性为50.9%-100%。结论2018年1月至2019年1月福州地区急性下呼吸道感染住院儿童呼吸道病毒检测的感染率为20.0%,其中RSV阳性率最高,在检出的阳性标本中占80.5%。感染的季节主要在春季和冬季,在2018年3月和2018年12月各出现一个高峰期,2018年12月达到感染率最高值(27.3%)。其次是IFVA在2019年1月出现一个小的高峰期。HAdV、IFVB、PIV1/2/3型在2018年1月至2019年1月未出现明显的流行高峰。2018年1月至2019年1月RSV感染患儿中A、B两种亚型均有出现,但以A亚型为主,主要基因型为ON1。结合2016和2017本地区的流行特征分析,RSV感染的病原体从以B亚型为主转变为以A亚型为主,说明本地区连续三个流行年中RSV发生了优势基因型的改变。
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