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我国作为第一养猪大国,猪肉类产品占我国肉类消费的65%左右。养猪业是我国畜牧业发展的重点,但目前我国养猪经济效益还有待改善。我国地方猪与西方猪之间经济性状有着较大差异。西方猪由于长期的人工选择使得猪的经济性能不断提高,而中国地方猪由于选择的目的不同且选择的强度较弱,目前在瘦肉率、生长速度等重要的经济性状上与西方猪还存在较大的差距。人工选择的不同是中国地方猪与西方猪的经济性状产生较大差异的原因。本研究首先利用高通量测序数据对中西方猪种的选择信号差异进行了分析,筛选中西方猪种中受到强烈选择的基因,结果显示IGF1R、Ras GRP1及Ins R基因在中西方猪种中受到强烈选择,然后对等位基因差异表达情况进行了研究并进行了位点保守性分析,预测出关键的功能调控位点进行后续的分子水平研究及群体研究,以期望找到对猪进行品种改良的关键分子标记。本研究得到的主要结果如下:(1)通过选择信号分析发现IGF1R、Ras GRP1及Ins R基因在中西方猪种中受到强烈选择,并通过等位基因差异表达研究和物种保守性分析找到3个很可能影响基因表达的候选功能位点。(2)凝胶迁移实验结果发现转录因子YY1能够结合IGF1R基因-61K A/G多态位点,且对等位基因G有更强的结合能力。双荧光素酶报告基因系统活性检测证明该位点能够促进下游基因表达,且G等位基因发挥的作用更强。然后通过RNA干扰实验发现转录因子YY1表达降低能够抑制IGF1R的表达。(3)凝胶迁移实验结果显示转录因子Myo D能够结合IGF1R基因Intron20 G/A多态位点,且对G等位基因有更强的结合能力。然后通过荧光定量PCR发现小鼠骨骼肌卫星细胞分化后IGF1R和Myo D的表达量都着极显著的升高。(4)对IGF1R基因-61K A/G多态与杜洛克×二花脸F2群体免疫及生长性状进行关联分析,结果表明该位点与33日龄嗜酸性粒细胞比率极显著关联(p<0.01),与80日龄体重显著关联(p<0.05),可以作为对猪生长及免疫性状改良的候选分子标记。(5)对IGF1R基因Intron20 G/A多态与杜洛克×二花脸F2群体免疫及生长性状进行关联分析,结果表明该位点与33日龄嗜酸性粒细胞比率及80日龄体重都显著关联(p<0.05),可以作为对猪生长及免疫性状改良的候选分子标记。(6)对RasGRP1基因+1K A/G多态与杜洛克×二花脸F2群体免疫及生长性状进行关联分析,结果表明该位点与80日龄体重显著关联(p<0.05),可以作为对猪生长性状改良的候选分子标记。