自从改革开放以来，我国在发展软件产业方面取得了巨大成绩。随着高等教育对计算机技术的普及，掌握计算机软件相关知识和技术的人员比例越来越大，很多软件从业人员选择了自主创业。一方面，新成立的中小型软件企业数量每年都在增加，另一方面由于经营管理不善，中小型软件企业时时面临着倒闭的风险。和传统的制造业不同，中小软件企业与其他行业相比有着自身的特点，存在着企业规模较小，盈利水平普遍偏低，质量保障体系不完善等特点，目前，中小软件企业财务内部控制普遍存在着很多问题，如：人力资本难于控制，内部控制的系统性和针对性欠缺，无法对每个项目的进行有效监控，信息化手段运用不充分，软件企业的优势得不到发挥。中小软件企业内部控制的实践还是一个薄弱环节，这已经成为制约软件企业可持续发展和壮大的障碍。中小软件企业需要通过财务内控实现管理水平上的提高，通过立项人工成本测算、全面预算管理、价值链成本控制、合同控制这几个内部控制的关键环节的有效控制可以提高企业整体的管理水平和盈利能力，最终将内部控制的结果应用于企业的经营管理，实现企业的利润最大化。将财务内部控制理论应用于软件企业实践，从每个软件项目的立项着手，通过信息化手段结合全面预算进行成本控制，将一套自行开发的内部控制软件应用于A企业，改善了管理流程，提高了经营的效率和效果，并得出研究的不足和后续研究的方向。