随着我国经济的高速发展，城市化进程逐步加快，城市交通虽然发展迅速，却仍然无法满足群众的出行需求，非法营运车辆数量存在逐渐增多的趋势，日益突出的非法营运问题损害了城市良好形象，影响了城市交通的良性发展，造成国家税收和管理费收入的大量流失，并对公众的生命财产安全有巨大危害。菏泽市非法营运车辆的日益增多，严重扰乱了正常的客运市场秩序，危及社会安全与稳定。菏泽市政府部门对非法营运车辆进行了集中治理，虽然取得了一定的效果，但仍然无法根治非法营运问题。本文通过运用文献法、访谈法、理论分析法对菏泽市非法营运车辆治理的现状、存在的问题及原因进行了研究探讨，并借鉴上海、美国等国内外的治理经验，针对菏泽的实际情况，提出了菏泽市非法营运车辆治理对策。为政府部门治理非法营运车辆提供有利的理论支持，并对国内其他中小城市具有一定的借鉴意义。菏泽市非法营运车辆治理存在的问题包括依法治理难、群众支持难、车辆处理难和难以坚持长期治理。主要原因是治理制度不完善、公共交通发展落后、监督体制不完善和管理资源短缺。针对这些问题，本文借鉴了上海、北京、香港、美国和印度的治理经验，从五个方面提出了治理对策，一是完善相关政策法规；二是大力发展公共交通；三是发挥第三方的监督作用；四是改革出租车管理模式；五是完善社会保障制度。非法营运车辆治理工作是一个长期的工作，需要政府部门长期的坚持，才能做到维护交通营运市场秩序，保障人民群众的生命财产安全和出行需要。