随着我国经济的发展，我国的商业市场显著增长，连续十多年保持了10％以上的增长速度，已由传统百货为主的单一业态发展到百货商店、连锁店、折扣店、便利店、大卖场等多种业态。然而，我国商业企业的经营管理却相对滞后，这就要求我国的商业企业不断提高经营管理水平。本文首先通过对商业企业会计核算和财务分析的分析，总结出了商业企业会计核算和财务分析的特点；然后对现有财务诊断相关方法进行整合，使之形成一个有层次有步骤的方法链，通过其中反映商业特点的指标选取，使之更适应商业企业特点。最后在此基础上构建了一个反映商业企业特点的多层次的财务诊断体系，为计算机辅助诊断系统的开发奠定理论基础。本体系所需的数据是企业的资产负债表、利润表、现金流量表和一些相关的经营数据，分析过程采用从总体到局部的逻辑思维模式，其结果多以图表形式表达，所以具有数据容易取得、操作简单、流程清晰和直观易懂的特点。本文构建的财务诊断体系包括三个环节三个层次。三个环节按诊断的流程分为数据收集环节、数据分析环节和结果报告环节。其中数据分析环节是整个体系的核心，由三个层次构成：1．综合层：是对企业综合状况的分析。其分析方法包括雷达图法、盈亏平衡分析、经营杠杆分析；2．指标层：是体现商业特色的所在，也是联结综合层和因素层的桥梁，由盈利能力、营运能力、偿债能力、发展能力、现金流量五方面共20个指标组成。其分析方法包括指标分解法、因素分析法、趋势分析法；3．因素层：是对报表项目的分析。其分析方法包括结构分析法、趋势分析法。