内生真菌在植物对抗环境压力和增加生物量等方面起着重要作用。陆生植物的内生真菌己有相关研究,但分布更为广泛的水生植物的内生真菌却没得到关注。少量的研究结果显示,相对于陆生植物,水生植物的内生真菌种类独特,物种丰富,在水生植物抵抗环境压力方面也发挥着重要作用。而且水生植物在检测地理格局和环境梯度对生物多样性的影响方面是一个好的案例,对水生植物内生真菌分布格局的研究也将丰富生物多样性研究的内涵。在2014年8月份和2015年8月份期间,课题组分别在在云南省、四川省和贵州省境内的多个湖泊、河流以及水塘中,采集优势水生植物31种,用纯培养的方法分离其中的内生真菌,并结合形态学和核糖体RNA内部转录间隔区进行了鉴定,研究结果如下：1.总计从15373个植物组织片段中分离得到1697株真菌,其中1341株得到鉴定,分属于156个属,分布在74个科,35个目,14个纲和5个门中,充分显示了水生植物内生真菌的多样性。2.和陆生植物相比,水生植物内生真菌中担子菌、水生丝孢菌所占比例略高,而且有1 8个属从未在陆生植物中报道过,包括Necator, Phaeophlebiopsis等担子菌和Setophaeosphaeria, Heydenia等水生丝孢菌。3.生境、水生植物种类、同一植物的不同组织,内生真菌分离频率和种群多样性差别较大。生境中最高的分离频率在抚仙湖,为19.6%,最低的在伍须海,为2.4%；在所研究的水生植物中,红菱内生真菌的分离频率最高,为60%,荇菜最低,为5.2%；对于同一植物而言,叶片组织分离到的内生真菌多样性稍高,是11.5%,茎内的分离频率最低,是10.5%。4.针对同一种植物,海拔对内生真菌分离频率和组成也有影响,随着海拔升高,内生真菌的分离频率和多样性整体呈现降低的趋势。分离频率最高的出现在海拔1000到2000m之间,为13.15%；最低则在海拔2000—3000m间,为9.72%。最高的多样性的在海拔2000到3000m间,最低的在4000以上,香农指数分别为5.33和4.55。5.水生植物内生真菌优势属中,有相当一部分是陆生植物病原菌。如炭疽菌属(Colletotrichum),芽枝霉属(Cladosporium)和Cytosporina等都是广为分布的,这与采样地周边环境有关,如人为活动多、周边种植有经济作物的地方,水生植物内生真菌中就会有较多病原菌的分布。