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目的:通过全基因组关联研究（Genome-wide association studies,GWAS）验证广西壮族自治区汉族人群中单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphisms,SNPs）位点rs884309和rs1464938与尿路上皮癌（bladder transitional cell carcinoma,TCC）发病相关性,同时探索其与TCC病理分级、临床分期的相关性。方法:（1）从右江民族医学院附属医院和附属西南医院收集病理组织,排除了那些有癌症家族史（包括非黑素瘤皮肤癌家族史）并且术前接受过化疗或放疗的患者,其中有331例患者经过病理证实为尿路上皮癌类型,另外选取同时期来右江民族医学院附属医院和西北附属医院未罹患肿瘤、年龄、性别与病例组进行对照的516名健康志愿者,病例和对照组的平均年龄分别为68.5±9.2岁和62.5±8.2岁。病例和对照组的男女比例都在4:1左右,所有研究对象均为广西壮族自治区无亲属关系的汉族人。抽取每名患者4ml静脉血液并对血液样本进行全基因组DNA提取,通过ABI 7500 Fast Real-Time PCR系统使用Taq Man assay（Applied Biosystems,Carlsbad,CA,USA）对3个SNP进行基因分型。随机抽取约5%的样本进行Sanger测序,验证其准确性。根据说明书手册,使用SYBR Green Master Mix（Qiagen）进行q PCR,通过GAPDH 2-ΔC标准化定量FGF12m RNA。扩增FGF12的启动子区,其中包含rs1464938A或rs1464938G,经Nhe I和Hind III消化后,将片段插入到p GL3基载体（Promega,Madison,WI）中,通过Sanger测序验证插入物在质粒中的定位和完整性。用Lipofectin 2000转染1μg p GL3-rs1464938A或p GL3-rs1464938G质粒（Life Technologies）。以肾草荧光素酶载体p RL-SV40（50 ng）作为内参（Promega公司）共转染。转染48 h后检测p GL3-rs1464938A和p GL3-rs1464938G启动子活性。（2）采用连续变量的t检验和分类变量的χ2检验比较病例与对照组人口统计学特征的差异。采用拟合优度χ2检验评价各SNP的Hardy-Weinberg平衡（HWE）和基因型及等位基因频率。通过使用二分类logistic回归模型计算比值比（OR）和95%置信区间（CI）,估计3个SNP与TCC风险之间的关系。使用SHEsis在线软件（http://analysis.bio-x.cn/my Analysis.php）进行单倍型分析。在不同质粒中荧光素酶活性的差异通过t检验来校对。所有测试均采用SPSS 22.0软件,检验以P<0.05定义为差异有统计学意义。结果:（1）统计学分析得出病例组平均年龄明显高于对照组（P<0.001）,表明年龄为TCC的危险因素。在性别差异上,病例组和对照组之间无显著差异（P=0.15）。根据Hardy-Weinberg平衡定律,对照组中rs884309 and rs1464938基因型的分布频率（P>0.05）,有良好的代表性。（2）TCC患者rs884309确定调整后的ORs和95%的CI来评估rs884309和TCC风险之间的关联。这些比较显示可见OR略有升高（GT vs GG:校正OR=1.14,95%CI,0.82-1.57,P>0.05;TT vs.GG:校正OR=1.20,95%CI:0.77-1.87,P>0.05;T vs.G:调整后OR=1.10,95%CI:0.89-1.36,P>0.05）。TCC患者rs710521确定调整后的ORs和95%的CIs来评估rs884309和TCC风险之间的关联。这些比较显示可见OR略有降低（AG vs AA:校正OR=0.69,95%CI:0.43-1.10,P>0.05;GGvs AA:校正OR=0.80,95%CI:0.33-1.93,P>0.05;G vs A:调整后OR=0.81,95%CI:0.56-1.16,P>0.05）。（3）TCC患者rs1464938 AA基因型和A等位基因频率明显高于对照组。确定调整后的ORs和95%的CIs来评估rs1464938和TCC风险之间的关联。这些比较显示OR显著升高（AA vs GG:校正OR=2.54,95%CI:1.49-4.35,P<0.001;AA vs AG/GG:校正OR=2.25,95%CI:1.36-3.71,P=0.002;A vs G:调整后OR=1.44,95%CI,1.15-1.80,P=0.001）。（4）检测到4种常见的单倍型:rs884309Grs1464938G、TG、GA、TA。TCC患者的GA单倍型频率明显高于对照组。通过测定ORs和95%CIs来评估单倍型与TCC风险的相关性。比较显示OR显著升高（GA vs GG:OR=1.61,95%CI:1.23-2.11,P=0.001）。结论:（1）本研究发现SNP rs1464938与广西汉族人群TCC发病风险显著相关,但与TCC病例分级、分期无明显相关性。（2）本研究发现SNP rs884309、rs710521与广西汉族人群TCC发病风险以及TCC病例分级、分期无明显相关性。（3）本研究发现TCC患者的GA单倍型的基因型频率明显高于对照组基因型频率,所以GA单倍型是TCC患者患病的危险因素。（4）本研究发现rs1464938 AG/AA基因型通过增加FGF12启动子活性而显示出更高水平的FGF12 m RNA。这可能加强FGF12的细胞因子作用,从而促进肿瘤生长。