自2013年以来,国务院先后批复成立了上海、广东、重庆等13个自由贸易试验区并赋予自由贸易试验区更大改革自主权,探索建设自由贸易港。随着中国自由贸易试验区改革的加快,2018年海关总署加紧了海关监管政策的改革,全面通关一体化逐渐开展起来,其中海关在深化改革保税货物监管方式中将监管车辆要求、查验要求变得更加简化快速。在这种背景下,加快改革自由贸易试验区内企业保税物流运作模式已刻不容缓,迫切需要优化和改良保税物流各业务形态的流程运作。基于此,本文以重庆J物流公司为研究对象,针对其公司保税物流业务市场逐渐被侵蚀这一困境,深入探究公司保税物流业务流程优化的关键障碍要素,寻求科学优化业务流程关键路径的主要举措。本论文以重庆J物流公司保税物流业务为背景,通过对短驳、转关和海运等核心保税业务流程的研究、分析和优化提升企业的运作效率。首先,对论文的研究背景以及意义进行了的阐明,对研究思路、方法和相关理论进行了阐扬。其次,运用了专家访谈法和鱼骨图法分析了重庆J物流公司在保税物流业务流程上所存在的问题。第三,运用业务流程改进(BPI)理论指导保税物流业务的优化,采用ECRS分析法对职能部门、车辆调度、运输环节控制等节点进行分析,找到节省运作成本和提升运作效率的流程优化具体方案,并且采用专家意见法和关联矩阵法对优化后的保税物流业务流程进行绩效评测。第四,提出了从组织结构调整、大数据结构体系建设、SOP管理制度设置等配套保障方案。本文对重庆J物流公司在保税物流主要业务流程的优化分析研究,为保税物流行业相关企业提供流程优化路径和模型。通过对重庆J物流公司保税物流业务流程的优化,使重庆J物流公司在保税物流业务中拥有了一套适合于其发展的保税物流流程。保税物流业务运作要提速,不仅仅只是将运作流程简化,而且需要组织结构、流程管理等整套体系的建设和优化。本论文最大限度的运用职能部门组织结构调整的功能,简化操作手续,节约人力资源成本,还大大的提高了物流运作效率,最后达到提升客户满意度的目的,同时保持了其在保税物流市场的竞争力。