基于16S rRNA全长测序的后生元含片辅助龋病充填治疗人群的口腔菌群分析

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目的:本研究通过对后生元含片辅助龋病充填治疗14天的人群进行随机对照试验,探究后生元含片对龋病充填治疗后口腔菌群的调节作用。方法:招募90名志愿者,分为A组(后生元辅助充填治疗组,41名),B组(龋病充填治疗组,40名),C组(口腔健康组,9名)。所有志愿者在治疗后0、14天采集口腔唾液样本,定义组别为A_0、A_14,B_0、B_14,C_0、C_14。采集的口腔唾液样本进行16S rRNA全长测序,测序结果通过生物信息学分析。结果:1.后生元辅助充填治疗、龋病充填治疗和口腔健康人群的口腔菌群多样性分析显示,与C组不同,A组、B组样本第14天比第0天的菌群alpha多样性明显下降,其中A组比B组的菌群alpha多样性下降更明显(P<0.001)。治疗14天后,A_14组的菌群丰富度显著高于B_14组,菌群更加稳定(P<0.01)。Beta多样性分析显示,A组、B组的菌群多样性下降明显改变了菌群结构(A0vs A14,P=0.004,R~2=0.027;B0 vs B14,P=0.005,R~2=0.025)。虽然A_14、B_14与C_14组的菌群结构无明显差异,但A_14组的菌群结构比B_14组更接近C_14组(A_14 vs C_14,P=0.602,R~2=0.019;B_14 vs C_14,P=0.299,R~2=0.024)。2.后生元辅助充填治疗、龋病充填治疗和口腔健康人群的口腔菌群物种差异分析显示,治疗14天后,A、B组从以龋病相关厚壁菌门、链球菌属为主的菌群转变为以变形菌门、假单胞菌属为主的菌群(LDA>4,P<0.001)。与C_14组相比,A_14组中富含健康相关的变形菌门、奈瑟菌属(LDA>4,P<0.001),而B_14组中存在显著丰富的菌群失调相关的蓝藻细菌门(LDA>4,P<0.001)。同时,与B_14组相比,A_14组中富含健康相关的奈瑟菌属(LDA>4,P<0.001),而B_14组中富含龋病相关的厚壁菌门、链球菌属(LDA>4,P<0.001)。结论:龋病充填治疗可部分恢复失衡的口腔菌群。后生元含片通过增加菌群稳定性,使失衡菌群向健康菌群转变来调节龋病充填治疗后的口腔菌群,从而改善龋病患者的预后。
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