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着丝粒是真核生物染色体重要的结构元件。在细胞有丝分裂和减数分裂时期,着丝粒精确调控染色体的配对与分离并维持染色体结构的稳定。植物着丝粒DNA序列主要由卫星序列和反转录转座子构成。着丝粒功能极其保守,但物种间DNA序列的变异性较大,呈现一种快速进化的模式。甘蔗是重要的糖料作物,其糖产量约占全球的四分之三。目前,甘蔗野生种割手密(Saccharum spontaneum)的全基因组测序工作已启动。然而,甘蔗基因组的结构和组成比较复杂,重复序列含量较高,尤其是富含重复序列的着丝粒区域,严重阻碍了其序列拼接