IL-1基因多态性与胃癌的关联性研究及功能验证

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全世界范围内,胃癌仍然是发病率和死亡率最高的恶性肿瘤之一,近年来其发病率呈现明显的上升趋势且呈现年轻化趋势,严重威胁居民的身心健康。胃癌的发生发展是一个多步骤、多因素、多阶段及多种机制共同作用的结果,包括基因因素,生物因素以及多种环境危险因素。流行病学研究结果显示炎症反应,细胞因子以及免疫介质参与到了胃癌的发生发展过程中,参与其中的炎性细胞因子,尤其是IL-1家族,可以显著地影响胃癌的易感性。目的研究IL-1家族基因(IL-1A rs2856836,IL-1R1 rs3732131,IL-1RN rs9005,IL-18RA rs1135354以及rs3771157)3’-UTR区的单核苷酸多态性(SNPs)和胃癌易感性的关系,为预防胃癌提供理论支持,进一步验证预测出的miRNA-mi R-92a,为IL-1家族基因相关miRNA在胃癌中的作用提供理论支持。方法1.运用生物信息学网站及软件筛选IL-1家族基因3’-UTR内的miRNA靶序列SNPs,预测其可能存在的结合位点。2.采用病例-对照的研究方法,收集500例医院来源且经病理学诊断确诊的胃癌患者及按别及年龄进行频数匹配的社区来源的500例正常对照的血液样本,采用聚合酶链性式反应-限制性片段长度分析法(PCR-RFLP)对IL-1A rs2856836,IL-1R1 rs3732131,IL-1RN rs9005,IL-18RA rs1135354以及rs3771157进行基因分型。采用SPSS21.0软件包对病例组和对照组的一般特征、不同基因型、等位基因的分布差异进行统计分析;Hardy-Weinberg在线分析软件对对照组进行Hardy-Weinberg平衡分析;SHEsis在线软件进行单体型分析;MDR2.0软件进行基因-环境交互作用的分析。3.采用qRT-PCR方法对miR-92a,miR-21和mRNA IL-1RN,PTEN的相对表达量进行检测,Western-Blot方法对IL-1RN,PTEN蛋白的表达水平进行检测,以此判断IL-1RN是否为miR-92a的靶基因,进一步探讨其在胃癌发生发展过程中的调控机制。结果1.SNPs基因分析结果:IL-1RN rs9005位点SNP与胃癌密切相关。与GG纯合基因型相比,GA杂合基因型(OR调整:1.36;95%CI:1.04-1.78)和AA纯合基因型(OR调整:1.71;95%CI:1.04-2.81)在调整混杂因素吸烟、饮酒及家族史后能显著增加胃癌的发病风险;与G等位基因相比,A等位基因与胃癌的发病风险增加显著相关(OR调整:1.34;95%CI:1.09-1.64);2.基因-环境因素的交互作用分析:具有吸烟史,肿瘤家族史以及携带有IL-1RNrs9005 A等位基因的人群患胃癌的风险是对照人群的2.07倍;3.qRT-PCR结果:在SGC-7901和BGC-823两种胃癌细胞中,miR-92a及miR-21的相对表达量在过表达组以及抑制剂组中差异均具有统计学意义(P<0.05);在BGC-823胃癌细胞中,mRNA IL-1RN及mRNA PTEN的相对表达量在过表达组中的差异具有统计学意义(P<0.05),在SGC-7901胃癌细胞中,mRNA PTEN的相对表达量在过表达组和抑制剂组中的差异均具有统计学意义(P<0.05)。4.Western-Blot结果:在SGC-7901细胞中,IL-1RN蛋白在过表达组和抑制剂组中的表达量差异均无统计学意义(P>0.05);在BGC-823细胞中,GenePharma-miR-92a在过表达组可下调IL-1RN的表达,在抑制剂组可上调IL-1RN的表达。而GenePharma-miR-21在SGC-7901细胞和BGC-823细胞中均表现为过表达组可下调PTEN的表达,在抑制剂组可上调PTEN的表达。结论1.位于IL-1RN基因3’-UTR内的SNP rs9005的GA/AA/GA+AA基因型可增加胃癌发病风险,具有吸烟史,肿瘤家族史以及携带有rs9005 A等位基因的人群患胃癌的风险较高;2.GenePharma-miR-92a过表达载体成功转染人胃癌细胞SGC-7901和BGC-823,上调了miR-92a在BGC-823中的表达,且负性调控了IL-1RN蛋白的表达。在BGC-823细胞中IL-1RN可能是miR-92a的靶基因。
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