新疆位于我国西北部，面积166万多平方公里，是我国面积最大的省区。我们于2001年7月至8月期间对新疆4个地区3个自治州1市的17个采集点进行了藻类标本采集，共采集到标本144号。经鉴定分析，发现管壳缝目硅藻63种30变种1变型，共94个分类单位，隶属于3科10属。其中窗纹藻科有3属，有细齿藻属2种，窗纹藻属6种8变种，棒杆藻属5种4变种；菱形藻科3属，有杆状藻属1种，菱板藻属3种4变种1变型，菱形藻属28种7变种；双菱藻科4属，有波缘藻属3种3变种，双菱藻属13种4变种，长羽藻属、马鞍藻属各1种。在这些种类中，属于中国新记录的有14种5变种，属于新疆新记录的有4属45种20变种1变型。同时，我们对管壳缝目硅藻的生态分布特征作了简要的分析。发现管壳缝目硅藻的分布受区域气候、地理位置等的影响并不显著，而受所处水体的小环境的影响较为明显，在临时性水体以及湖边渗出水、沼泽中管壳缝目硅藻的种类多，数量也多；而在溪流、河水、湖水等水体中种类和数量都很少。在种类组成上，普生性种类、适碱性种类丰富，固着种类多；淡水、半咸水种类广泛分布，喜盐种类突出；真性浮游种类少。