应用基因表达谱芯片筛选结肠癌发生相关基因

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目的:通过基因表达谱芯片技术筛选结肠癌发生相关基因,以期待找到在结肠癌发生中起关键作用的基因及基因所在信号通路,从而为阐明结肠癌发生的机制、结肠癌的早期诊断、个性化治疗和预后预测奠定理论基础。方法:从结肠癌组织及其配对的正常结肠组织中抽提RNA并合成cRNA,利用美国Agilent的基因表达谱芯片对cRNA进行标记、杂交、扫描,得到结肠癌组织和正常结肠组织的差异表达基因数据,通过对筛查出的差异表达基因进行GO基因功能分析、KEGG pathway功能分析和String蛋白互相作用关系分析,找到与结肠癌发生相关的关键基因及其所在信号通路。结果:1.应用基因表达谱芯片,筛选出差异表达基因共计3986个,其中上调差异表达基因有2807个,下调差异表达基因有1179个。2.发现差异表达基因所在通路多条,与肿瘤发生相关通路主要有Wnt信号通路、PI3K-Akt信号通路、Jak-STAT信号通路、ErbB信号转导通路、MAPK信号通路、细胞周期、TGF-β信号通路以及细胞凋亡等;发现结肠癌发生相关基因24个。结论:本实验中首次发现ACVRIB, AKT3, CYCS, MAPK9, PIK3CB等5个结肠癌发生相关基因,在此前的文献中均未见报道,可能是结肠癌发生相关的新基因或结肠癌治疗新靶点。对这些关键基因及信号通路的进一步实验分析,将对以后的结肠癌诊断、预后及靶向治疗提供重要理论依据。
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