籽用美洲南瓜种质资源遗传多样性分析及指纹图谱的构建

来源 :内蒙古农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:HZ8081
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籽用美洲南瓜俗称籽用西葫芦(Cucurbita pepo L.),为葫芦科(Cucurbitaceae)南瓜属(Cucurbita)草本植物,以种子作为主要食用器官。我国籽用美洲南瓜的生产主要集中在黑龙江、新疆和内蒙古三大产区,是重要的经济作物和深具特色的出口创汇型作物。由于籽用南瓜遗传育种起步较晚,目前生产上优良籽用美洲南瓜种质资源较少,且遗传背景较窄,严重限制了籽用美洲南瓜种育种材料的创新与利用。开展籽用美洲南瓜种质遗传多样性研究可为籽用美洲南瓜种质的亲本选配、保护和鉴定提供理论依据。试验以来自4个不同地区的48份籽用美洲南瓜种质资源为研究材料,通过观测和记录其生长过程中种质间的表型差异,对这些种质进行聚类并分析。利用筛选出的20对多态性引物对48份种质的DNA样本进行扩增,基于扩增结果进行多样性分析,并建立指纹图谱。主要试验结果如下:(1)植物学性状遗传多样性参数的统计分析结果显示:31个形态学性状的变异系数介于15.16%~86.00%之间。其中变异系数最大的为叶面白斑(86%),最小的是生长习性(15.16%),与质量性状相比数量性状的遗传变异系数整体较低。(2)基于植物学性状的聚类分析将48份供试籽用美洲南瓜种质在欧氏距离为7.67处分为6个类群,聚类分析结果比较好地反映了籽用美洲南瓜种质间的形态相似性。(3)经过筛选的20对引物在48份籽用美洲南瓜种质中扩增出115条具有多态性的等位基因,位点的Shannon信息指数(I)均值为1.36、遗传多样性指数(H)均值为0.69、多态性信息指数(PIC)均值为0.63,表明其具有较高多态性。综合各项指标,筛选出5对核心引物,将48份种质完全区分并构建指纹图谱。(4)对群体间的遗传多样性和遗传距离进行分析,结果表明来自内蒙古呼伦贝尔市的种质与来自山西省的种质亲缘关系最远,来自内蒙古巴彦淖尔市的种质与来自甘肃省的种质间亲缘关系最近。来自内蒙古呼伦贝尔市的种质遗传多样性相对较差,来自甘肃省的种质的遗传多样性相对较为丰富。(5)基于SSR分子标记的48份籽用美洲南瓜种质聚类结果表明,48份种质在遗传相似系数为0.66处分成两大类,其中,第Ⅰ类包含46份种质,在遗传相似系数为0.68处又将其分为三个亚类,第一亚类包含18份种质,第二亚类包含10份种质,第三亚类包含3份种质,第Ⅱ类包含2份种质,聚类结果与种质地理来源关系密切。将形态学标记和分子标记聚类分析结果进行—致性检验,相关系数r=0.20,说明两种标记在本研究中对供试材料的分类的一致性较低。
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