过表达甲基转移酶对大肠杆菌耐药性的影响

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大肠杆菌有四种DNA甲基转移酶:腺嘌呤甲基转移酶Dam、胞嘧啶甲基转移酶Dcm、腺嘌呤甲基转移酶Hsd M和腺嘌呤甲基转移酶Yhd J。目前认为,大肠杆菌DNA甲基化作为大肠杆菌表观遗传调控的主要模式,对细胞周期调控、基因表达调控、宿主防御和毒力调节等进程有重要作用。但大肠杆菌DNA甲基化与抗生素耐药性之间的关系尚不明确。本论文主要通过DNA甲基转移酶的过表达对大肠杆菌耐药性的影响来揭示DNA甲基化是作为基因表达调控的一个“总开关”参与到大肠杆菌耐药机制中。本研究通过构建DNA甲基转移酶Dam、Dcm、Hsd M和Yhd J过表达株以及耐药性测试证明了不同的DNA甲基转移酶过表达能够强化大肠杆菌对不同类型抗生素的耐药性。通过诱导剂的剂量梯度证明了耐药性的强弱与DNA甲基转移酶的表达量成正比。通过基因敲除和回补验证了大肠杆菌氨基糖苷类耐药性和喹诺酮类耐药分别与DNA甲基转移酶Dam和DNA甲基转移酶Hsd M的过表达相关。通过动物实验证明了DNA甲基转移酶Dam过表达增强大肠杆菌氨基糖苷类耐药性的表型在小鼠体内是相同的。此外,还通过斑点印迹杂交(Dot Blot)证实了DNA甲基转移酶Dam的缺失和过表达会直接影响大肠杆菌基因组DNA的6m A修饰水平,但DNA甲基转移酶Hsd M的缺失与过表达对大肠杆菌基因组DNA的6m A修饰水平几乎没有影响。由于DNA甲基转移酶Dam的缺失与过表达对大肠杆菌基因组DNA的6m A修饰水平影响很大,DNA甲基转移酶Dam的深入研究对进一步发现和挖掘大肠杆菌耐药的分子机制,尤其是DNA甲基化与大肠杆菌氨基糖苷类耐药的分子机制,具有重要意义。因此,DNA甲基转移酶Dam作为后续研究的主要对象进行了基因组、转录组和代谢组组学分析。分析结果显示电子传递复合体中的rsx ABCDEG基因簇的转录水平全部上调。通过菌株构建和耐药性测试我们发现Rsx C过表达也会增强大肠杆菌对氨基糖苷类的耐药性,且耐药性与Rsx C表达量成正比。此外,抑菌圈实验证实了Rsx C的过表达产生了能部分降低庆大霉素杀菌作用的钝化酶或修饰酶。本研究的结果表明,过表达不同的DNA甲基转移酶能赋予大肠杆菌对不同类型抗生素的耐药性,Rsx C作为DNA甲基转移酶Dam调控的下游基因,在过表达后同样增强大肠杆菌对氨基糖苷类的耐药性。
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