目前，我国正处于由传统农业向现代农业转变的关键时期，协同创新已成为现代农业科技创新的发展方向和有效选择，是涉农高校科技创新能力提升的最有效途径。从我国农业科技创新的现状来看，科技创新的主体主要集中在高等院校、科研院所和行业企业，主体之间各自为政、散兵作战，缺少有效的“跨学科、一站式”协作平台和协同创新机制，难以集中各自的创新队伍和丰富的创新资源及创新优势，难以集中力量、协同攻关，真正形成服务“三农”发展和现代农业建设的科技创新核心竞争能力。在这种背景下，作者拟以吉林大学为个案，从理论上试图构建一个适合于现代农业发展的现代农业科技协同创新平台，并建立相应的运行机制保障该平台有效顺利的实施。这对于推动各类农业科技的协同创新，促进同步发展，建设美丽乡村等都有着重要的现实意义和长远的战略意义，也为其他相关现代农业科技主体的协同创新提供有益的借鉴。论文的主要研究工作和结论可以概括如下：1.论文首先介绍了相关概念，产学研协同创新的基本理论，以及现代农业科技协同创新理论模式的分析及考量。2.以吉林大学为例构建了现代农业科技协同创新平台。阐述了现代农业科技协同创新平台构建的背景、思路、原则，构建了适合于现代农业发展的科技协同创新平台，给出了创新平台的运行机理。3.创新平台有效运行合作伙伴的选择。首先阐述了合作伙伴选择的动因、选择的基本原则、选择的程序、选择的方法等。其次构建了选择合作伙伴的相应指标。并利用层次分析法确定了指标权重，再结合层次分析法所获得指标权重，用模糊综合评判法对参与现代农业科技协同创新平台的备选主体进行评价。最后对合作伙伴的选择进行了实证，选择出合适的候选伙伴。4.构建了现代农业科技协同创新的运行机制。要保障现代农业科技协同创新平台有效运行，必须有相应的运营机制来做保障，分别给出了现代农业科技协同创新平台的合作机制、组织机制、行政机制。三个机制缺一不可，相辅相成。