‘黄花水仙2号’三个WD40相关基因克隆及表达分析

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中国水仙为三倍体,长期以鳞茎无性繁殖,其栽培品种退化趋势明显,抗逆性减弱。而随着城市化进程的不断推进,可以用于栽种水仙的良田大幅减少。因此,提高中国水仙的抗性,使其能够适应较为复杂的栽培环境,对中国水仙未来的持续发展至关重要。本研究从福建农林大学园艺学院水仙课题组已获得的多花水仙花瓣抑制消减杂交cDNA文库中筛选得到‘黄花水仙2号’的3个的编码WD40蛋白的基因片段NtWDl.NtWD2.NtWD3,通过RT-PCR和RACE技术克隆其cDNA全长。同时利用荧光定量PCR对上述三者和一个已知基因NtWD40进了不同组织部位中及七种非生物逆境下的表达分析,为中国水仙的种质改良和抗逆品种的选育提供参考。黄花水仙2号NtWDl.NtWD2.NtWD3基因的克隆通过RT-PCR和RACE技术从黄花水仙2号的花瓣中克隆得到了NtWDl基因cDNA全长及NtWD2、NtWD3基因的5’端部分。NtWD1基因包含一个3372bp的开放阅读框,共编码1126个氨基酸。N端含有一个LisH(lissencephaly homology)和一个CLTH(C-terminal to LisH)结构域,中部和C端共有11个WD40结构域。其二级结构具有TPL/TPR (TOPLESS/TOPLESS-RELATED)类共抑制因子的特征。三维构象模拟显示其有两个呈一定角度的七叶β-螺旋桨结构。系统发育树分析显示它和海枣、油棕、小果野蕉的亲缘关系较近。通过5’RACE得到NtWD2.NtWD3基因5’端部分,与已知片段拼接后得到了长为741bp的NtWD2基因片段和长为1639bp的NtWD3基因片段。黄花水仙2号NtWD1、NtWD2、NtWD3、NtWD40基因的表达分析根据BLAST (Basic Local Alignment Search Tool)分析,NtWD1基因编码的蛋白与TPL/TPR类共抑制因子相似度高,而NtWD2、NtWD3和NtWD40基因编码未注释功能的蛋白。通过实时荧光定量PCR技术对上述4个基因进行了组织特异性和七种非生物逆境(干旱、高温、机械损伤、MeJA.ABA、2,4-D、高盐)下的表达分析。结果表明,NtWD40在根中几乎不表达,NtWD3在根、叶、花瓣、副冠中的表达量基本一致。NtWD1、NtWD2在副冠中的表达量都略高于花瓣。NtWDl基因在MeJA.ABA.2,4-D.高盐、机械损伤等5组处理中基因表达量都出现了十分显著的上调,说明这个基因参与到了上述逆境响应中。NtWD2在盐胁迫处理中表达量变化最为显著。NtWD3在ABA和盐处理都山现了明显的上调。NtWD40在ABA和MeJA处理中都发生了显著的变化,但在机械损伤处理中表达量几乎不变。此外,在ABA处理中NtWD40在NtWDl之后出现了一个表达高峰。
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