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肺癌是世界上死亡率较高的癌症,Let-7与肺癌基因3UTR结合抑制肺癌基因的表达。本文研究目的探讨SNP(位于Let-7与肺癌基因3UTR互补区中的或者位于Pre—Let-7序列中的)是否影响Let-7与肺癌基因结合、从而影响Let-7对肺癌基因的调控及非小细胞肺癌患病风险的关系。
研究对象为中国华东地区83例NSCLC(非小细胞肺癌)患者及80例健康对照者,5株NSCLC细胞株(A549、SPC、95D、LTEP、NCI—H460),我们通过公开miRBase数据库(http://www.sanger.ac.uk/Software/Rfam)和HapMapⅡ期数据库(www.hapmap.org)检索到Pre—Let-7家族成员序列中没有常见SNP,Let-7与Kras3 UTR互补区中只有唯一的SNP,即rs712,位于Let-7与KRAS3UTR的LCS(Let-7 complementary site)1。运用聚合酶链式反应(PCR)扩增上述SNP,扩增产物以限制性酶切(RFLP)及凝胶电泳进行基因分型。利用回归分析计算优势比(odd ratios,OR)和95%可信区间(95% confidence intervals,95%CI),并对性别、年龄进行校正。
研究结果表明:(1)rs712的基因型与等位基因频率在非小细胞肺癌病例对照中均无显著差异。(2)rs712在5株肺癌细胞株基因型均为GG。(3)rs712的基因型频率和等位基因频率情况在非小细胞肺癌各个分期型、不同组织病理也没有显著差异。
本研究结果提示在NSCLC患者中,rs712与非小细胞肺癌的患病风险没有显著关系。LCS中SNP基因分型是否成为患病风险的检测方法之一,是否能帮助肿瘤的早期诊断,肿瘤分型,预测肿瘤复发、转移和判断预后提供重要的信息还需要进一步的研究。