【摘 要】
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目的:既往研究发现,急性髓系白血病（acute myeloid leukemia,AML）患者骨髓穿刺液样本中的细胞类型组成具有作为预后标志物的潜在价值。本研究旨在通过转录组去卷积方法估计AML患者确诊时样本中的细胞类型组成,并构建AML预后模型。方法:本研究利用AML单细胞RNA测序数据集GSE116256构建细胞类型特征基因表达谱,进而通过CIBERSORT去卷积方法估计基因表达数据集GSE6
【基金项目】
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国家自然科学基金项目的资助（No.82003561）；
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目的:既往研究发现,急性髓系白血病（acute myeloid leukemia,AML）患者骨髓穿刺液样本中的细胞类型组成具有作为预后标志物的潜在价值。本研究旨在通过转录组去卷积方法估计AML患者确诊时样本中的细胞类型组成,并构建AML预后模型。方法:本研究利用AML单细胞RNA测序数据集GSE116256构建细胞类型特征基因表达谱,进而通过CIBERSORT去卷积方法估计基因表达数据集GSE6891和TCGA-LAML中580名AML患者21种细胞类型的相对细胞比例。通过伪样本数据模拟评估去卷积结果的准确性,将准确估计的14种细胞类型纳入基于L1范数正则化的多因素Cox回归中,筛选具有预后意义的细胞类型并估计相应权重,最后构建可预测AML患者预后的细胞类型组成评分。结果:细胞类型组成评分由类粒细胞-巨噬细胞祖细胞、类造血干细胞和初始T细胞构成,权重系数分别为-1.567、0.145和-0.217。在训练集GSE6891中,校正年龄、性别、细胞遗传学风险分层、NPM1突变、FLT3突变、IDH1突变、IDH2突变后,细胞类型组成评分每升高1个标准差,AML患者的死亡风险增加1.27(1.08～1.50,P=4.5×10-3)倍,而在测试集TCGA-LAML中增加1.70(1.27～2.28,P=4.0×10-4)倍。传统预后模型在纳入细胞类型组成评分后,C指数分别由0.682（0.649～0.715）和0.765（0.718～0.812）提高至0.696（0.663～0.729）和0.783（0.738～0.828）,C指数的提高具有统计学意义(P=4.1×10-3和P=2.8×10-4)。此外,细胞类型组成评分的预后意义独立于既往研究中的LSC17评分和AP评分。结论:AML患者确诊时样本中的细胞类型组成与预后相关;细胞类型组成评分具有独立的预后意义,能够提升传统预后模型的预测效果,具有临床应用的潜力。
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目的:前列腺癌（Prostate Cancer,PCa）是男性肿瘤相关死亡的主要原因,对人类健康造成严重威胁。全基因组关联研究（Genome-Wide Association Study,GWAS）已经确定超过200个前列腺癌遗传风险位点,然而,研究者对这些位点发挥作用的生物学机制却知之甚少。本研究应用转座酶可及染色质测序技术（Assay for TransposaseAccessible Chr
目的:本研究旨在利用昼夜温差（DTR）和相邻两天温度变化（TCN）两种代表温度变化的指标多角度探讨温度变化对深圳市居民非意外死亡及其之中的循环系统疾病死亡和呼吸系统疾病死亡的影响。为相关部门规划适宜的公共卫生干预措施提供理论支持,以减少温度变化所带来的死亡负担。方法:利用从深圳市疾病预防控制中心获得的深圳市2013～2020年每日非意外死亡数据以及同期深圳市气象服务中心的气象数据,将非意外死亡进一
目的:探讨广东省及各市卫生资源配置现状及发展趋势、区域差异性和利用效率,旨在分析引起卫生资源配置不公平和利用效率低下的原因,以期为广东省卫生部门合理配置卫生资源,优化资源配置结构,提高卫生资源利用效率,促进区域间协调发展和推动卫生事业的改革与发展提供科学的参考依据。方法:通过广东省卫生健康统计年鉴搜集2013-2020年全省及各市的卫生资源相关数据,描述性分析和比较广东省及各市的卫生资源配置现状;
目的:良好的生活方式是非酒精性脂肪性肝病（nonalcoholic fatty liver disease,NAFLD）第一级预防的重要手段。本研究旨在较年青的人群全面评估整体生活方式与NAFLD的关联性,并进一步探索两者间的关联是否通过肥胖及血脂异常介导,为NAFLD的早期预防与控制提供依据。方法:本研究人群来自于武汉地铁职工人群队列,于2018年12月～2019年1月收集了武汉市地铁集团在岗职
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目的:免疫细胞组成的稳态可以为疾病的严重程度及预后提供线索。免疫细胞比例对急性冠脉综合征（acute coronary syndrome,ACS）的预后具有提示作用,且已有研究发现白细胞计数和中性粒细胞计数与ACS的发生风险有关,但较少研究探讨相应细胞比例以及淋巴细胞亚群比例与ACS发生风险的关联。此外,ACS的发生风险还与性别、吸烟、肥胖、高血压、高血脂和糖尿病等风险因素相关,但这些风险因素与免
目的:（1）探讨孕妇妊娠期亚微米颗粒物（Submicron particulate matter,PM1）暴露对其血糖水平、妊娠期糖尿病（Gestational diabetes mellitus,GDM）发病风险的影响。（2）探讨孕妇妊娠期PM1暴露对早产风险的影响。方法:选取同济母婴健康队列2013年1月1日至2016年12月31日纳入的单胎活产孕妇作为研究对象。通过卫星遥感数据、土地利用数据
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