【摘 要】
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目的:基于加权基因共表达网络分析与前列腺癌临床病理参数密切相关的基因,并研究KIF18B对前列腺癌增殖和迁移的影响。方法:利用GEO数据库中前列腺癌基因芯片GSE70768的数据进行加权基因共表达网络分析,筛选与临床病理特征密切相关的模块,并对模块中的基因进行蛋白质互作网络分析进而确定关键基因。利用TCGA数据库进一步验证关键基因,根据基因共表达分析和相关性分析筛选关键基因KIF18B。利用shR
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目的:基于加权基因共表达网络分析与前列腺癌临床病理参数密切相关的基因,并研究KIF18B对前列腺癌增殖和迁移的影响。方法:利用GEO数据库中前列腺癌基因芯片GSE70768的数据进行加权基因共表达网络分析,筛选与临床病理特征密切相关的模块,并对模块中的基因进行蛋白质互作网络分析进而确定关键基因。利用TCGA数据库进一步验证关键基因,根据基因共表达分析和相关性分析筛选关键基因KIF18B。利用shRNA敲减KIF18B的表达,qRT-PCR和Western blot验证KIF18B的敲减效率。通过MTT实验、流式凋亡检测、划痕实验、Transwell实验研究KIF18B对前列腺癌细胞增殖、凋亡、迁移和侵袭能力的影响。另外,利用基因表达谱芯片研究KIF18B敲减后下游基因的表达变化情况,将获得的差异基因进行功能富集分析和蛋白质互作网络构建,进而筛选关键靶基因,并对关键靶基因进行生存分析。结果:加权共表达网络分析共获得13个模块,其中洋红模块与各临床病理参数均显著相关(P均<0.05)。对洋红模块中的基因进行蛋白互作网络构建并筛选关键基因,发现KIF家族基因的KIF4A和KIF20A为洋红模块中的关键基因。利用Consensus Path DB进行信号通路富集分析发现洋红模块中的关键基因主要富集于cell cycle信号通路。利用TCGA数据库验证KIF家族基因在前列腺癌和癌旁组织中的表达,结果发现KIF家族基因成员KIF18B,KIF4A,KIF20A,KIF25差异表达显著(P均<0.05)。对上述基因进行共表达和表达相关性分析发现,KIF18B与KIF4A和KIF20A存在共表达关系,且表达相关性显著(P<0.05)。TCGA数据分析显示KIF18B在前列腺癌中高表达(P<0.05),并与无疾病进展生存期显著相关(P<0.05)。通过细胞学实验研究发现敲减KIF18B可显著抑制前列腺癌细胞增殖、迁移和侵袭能力,并促进凋亡。利用基因表达谱芯片对敲减KIF18B后差异显著的基因构建蛋白互做网络并筛选关键基因(POLR2E、HSPA8、CCNA2、PCNA、CDC6、MCM7、JAK1、RNF111、RFC3和SNRPF),进一步生存分析发现,CCNA2、SNRPF、CDC6和MCM7与的前列腺癌不良总体生存期和无疾病进展生存期相关(P均<0.05)。结论:KIF家族基因与前列腺癌临床病理参数密切相关,KIF18B在前列腺癌中高表达,与无疾病进展生存期密切相关。KIF18B可能通过cell cycle信号通路促进前列腺癌细胞增殖与迁移,并抑制凋亡。CCNA2、SNRPF、CDC6和MCM7是KIF18B下游的关键基因,与前列腺癌不良总体生存期和无疾病进展生存期相关。
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