基于加权基因共表达网络分析探讨KIF18B对前列腺癌增殖和迁移的影响

来源 :福建医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:pigdun
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:基于加权基因共表达网络分析与前列腺癌临床病理参数密切相关的基因,并研究KIF18B对前列腺癌增殖和迁移的影响。方法:利用GEO数据库中前列腺癌基因芯片GSE70768的数据进行加权基因共表达网络分析,筛选与临床病理特征密切相关的模块,并对模块中的基因进行蛋白质互作网络分析进而确定关键基因。利用TCGA数据库进一步验证关键基因,根据基因共表达分析和相关性分析筛选关键基因KIF18B。利用shRNA敲减KIF18B的表达,qRT-PCR和Western blot验证KIF18B的敲减效率。通过MTT实验、流式凋亡检测、划痕实验、Transwell实验研究KIF18B对前列腺癌细胞增殖、凋亡、迁移和侵袭能力的影响。另外,利用基因表达谱芯片研究KIF18B敲减后下游基因的表达变化情况,将获得的差异基因进行功能富集分析和蛋白质互作网络构建,进而筛选关键靶基因,并对关键靶基因进行生存分析。结果:加权共表达网络分析共获得13个模块,其中洋红模块与各临床病理参数均显著相关(P均<0.05)。对洋红模块中的基因进行蛋白互作网络构建并筛选关键基因,发现KIF家族基因的KIF4A和KIF20A为洋红模块中的关键基因。利用Consensus Path DB进行信号通路富集分析发现洋红模块中的关键基因主要富集于cell cycle信号通路。利用TCGA数据库验证KIF家族基因在前列腺癌和癌旁组织中的表达,结果发现KIF家族基因成员KIF18B,KIF4A,KIF20A,KIF25差异表达显著(P均<0.05)。对上述基因进行共表达和表达相关性分析发现,KIF18B与KIF4A和KIF20A存在共表达关系,且表达相关性显著(P<0.05)。TCGA数据分析显示KIF18B在前列腺癌中高表达(P<0.05),并与无疾病进展生存期显著相关(P<0.05)。通过细胞学实验研究发现敲减KIF18B可显著抑制前列腺癌细胞增殖、迁移和侵袭能力,并促进凋亡。利用基因表达谱芯片对敲减KIF18B后差异显著的基因构建蛋白互做网络并筛选关键基因(POLR2E、HSPA8、CCNA2、PCNA、CDC6、MCM7、JAK1、RNF111、RFC3和SNRPF),进一步生存分析发现,CCNA2、SNRPF、CDC6和MCM7与的前列腺癌不良总体生存期和无疾病进展生存期相关(P均<0.05)。结论:KIF家族基因与前列腺癌临床病理参数密切相关,KIF18B在前列腺癌中高表达,与无疾病进展生存期密切相关。KIF18B可能通过cell cycle信号通路促进前列腺癌细胞增殖与迁移,并抑制凋亡。CCNA2、SNRPF、CDC6和MCM7是KIF18B下游的关键基因,与前列腺癌不良总体生存期和无疾病进展生存期相关。
其他文献
目的:本研究旨在探究复发或转移性鼻咽癌患者PD-1单抗耐药后联合姑息放疗的疗效,观察联合姑息放疗下能否逆转机体对PD-1单抗的耐药以及是否发生“远隔效应”现象。材料和方法:本研究回顾性分析了我院12例PD-1单抗治疗后,且经RECISTv1.1评估为疾病进展的复发或转移性鼻咽癌患者,针对复发灶或转移灶给予总剂量为18Gy-36Gy、单次分割剂量3Gy-6Gy的局部姑息放疗,同时继续接受PD-1单抗
目的放射性肺炎(Radiation Pneumonitis,RP)是非小细胞肺癌放疗的常见并发症,也是肿瘤放疗提高剂量的主要限制因素。因此需要可靠的生物标志物来更准确的预测放射性肺炎,以制定个体化的治疗方案,降低放射性肺炎的发生。本实验采用非小细胞肺癌患者血清样本为研究对象,通过全蛋白组学定量分析筛选放疗后发生肺炎组和未发生肺炎组患者在不同时间点(0,3,6周)血清蛋白组表达的差异蛋白,进一步分析
目的1考察血白蛋白(Albumin,ALB)对替考拉宁(Teicoplanin,TEIC)血药浓度的影响。2考察感染合并低蛋白血症状态下给予不同治疗剂量的TEIC,其总浓度(Total concentration,Ct)和游离浓度(Free concentration,Cf)的变化以及药物疗效和不良反应,为临床上TEIC安全有效治疗合并细菌感染的低蛋白血症患者确定给药剂量提供参考依据。方法1低蛋白
背景:肺动脉高压(Pulmonary Hypertension,PH)是指在海平面静息状态下右心导管测定肺动脉平均压力持续超过20mm Hg,以持续性肺血管的收缩增强以及肺血管的重塑为特征,继而导致右心衰竭甚至死亡的一种疾病。血管钙化常见于衰老、慢性肾病、糖尿病和动脉粥样硬化,与心血管疾病的发病率和死亡率密切相关。血管钙化主要发生在血管中膜层,而中膜层的细胞主要以平滑肌细胞为主,所以血管中膜层钙化
目的:研究3D打印技术辅助肋骨骨折手术与常规手术疗效。方法:选择2017年7月到2019年3月我院胸外科所收治45位肋骨骨折患者。将这45位患者随机性地分为两组,一组是对照组,另一组则是治疗组。前瞻性研究分析两组患者的临床治疗效果。治疗组23位患者,接受3D打印技术辅助的肋骨骨折手术;对照组22位患者,接受常规手术。结果:(1)治疗组,手术时长(86.32±13.25)min,术中出血量为(96.
目的:通过竞争风险模型分析滤泡性甲状腺癌患者的生存状况和影响预后的危险因素,为滤泡性甲状腺癌的治疗和预后提供数据支持。方法:选取来自美国监测、流行病学和结果数据库(SEER)中1988年1月1日到2015年12月31日间诊断为原发性滤泡性甲状腺癌患者的生存数据,以患者死于甲状腺癌为兴趣事件,死于其他原因(如心血管疾病、呼吸系统疾病等)为竞争事件。连续变量记录其均值和中位数,分类变量进行计数并计算百
目的提高对糖尿病高渗状态(Hyperglycemic Hyperosmolar State,HHS)合并横纹肌溶解综合征(Rhabdomyolysis,RM)的认识,分析糖尿病高渗状态合并横纹肌溶解综合征相关临床特征。方法临床资料来源于2012年~2019年期间某三级甲等医院收治HHS患者108例,其中HHS合并RM 27例,进行回顾性对比分析。根据2009年ADA制定的诊断标准判定为HHS。而横
目的本文通过测定P16、Ki67、CK7及CDK4蛋白在宫颈上皮内病变的表达情况,探索四者的表达水平与不同级别宫颈病变之间的关系及意义。方法收集2019年5月至2020年1月期间在福建医科大学附属第二医院妇科就诊的所有资料完整且经过HE染色病理确诊的宫颈病变的患者148例和同期选择因良性疾病行全子宫切除或宫颈活检证实为慢性宫颈炎的患者35例,低级别鳞状上皮内病变组(low-grade squamo
目的探讨预后营养指数(Prognostic Nutritional Index,PNI)和胃癌患者术后并发症与远期预后的关系。方法回顾性分析2008年1月-2009年12月联勤保障部队第九〇〇医院收治的389例行胃癌手术的胃癌患者,收集其临床病理资料,术后并发症,生存时间等。计算PNI临界值采用受试者操作特征曲线(Receiver Operating Characteristic Curve,RO
目的:由于难治性高血压(RH)的治疗方法越来越多,对临床医生来说,区分哪种降压方案更优选是一项重要的任务。本文通过网状meta分析评价RH中多种降压方案的疗效。方法:从Pub Med、Embase和Cochrane数据库中检索相关文章。结局指标为24小时收缩压、24小时舒张压、诊室收缩压和诊室舒张压的变化,以加权均数差(WMD)和95%可信区间(95%CI)表示。采用成对和网状meta分析对相应干