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随着经济全球化与科技全球化程度的不断加深,科技创新已经成为企业和国家提升综合实力的主要途径。传统封闭式的创新模式的弊端已日益显露,因此企业开始寻求与高校和科研院所开展合作。但是很多产学研的合作都以失败告终,其中因利益分配问题而导致产学研联盟破裂的约占73.7%,可见利益分配问题是产学研联盟首要的矛盾,解决好利益分配问题是推动产学研合作的关键。构建科学合理的利益分配方法,对提升产学研联盟的运行效率,提高我国技术创新能力具有深刻的意义。立足于国内外学者的研究现状,研究了相关理论。按照项目价值评估—利益分配的思想,将期权和博弈作为整体方法研究产学研合作的利益分配问题。由于传统的价值评估方法侧重从静态角度进行评估,往往低估了资产的真正价值,因此引入了实物期权法,针对产学研项目的特点,构建了三叉树复合实物期权定价模型。根据评估得到的期权价值,构建了基于Shapley值法的产学研合作利益分配模型。由于Shapley值法分配利润时缺乏考虑投入因素和风险因素,因此对Shapley值进行了相应的改进,对Shapley值法进行风险修正的方法是将Shapley值法与实物期权法相结合,对投入因素的考虑,采用了投入因子进行修正。并将此整体方法应用到现实的产学研合作案例中。期权与博弈作为整体方法研究产学研合作利益分配问题,能够将项目蕴含的风险转化为潜在的收益,全面地评估了项目的价值,更重要的是,全面地把握了产学研合作项目在投资阶段以及合作阶段中面临的风险,这是基于风险因素的考虑而对Shapley值法提出的一种合理的修正方法。此外,利用B-S模型评估了技术专利与人力资本的期权价值,以此为基础计算了投入因子,基于投入因子对Shapley值进行了修正,从而形成了一套基于投入因素、贡献因素和风险因素的利益分配方法。本文采用了初等无穷小量阶数估计以及随机分析法,将二叉树期权定价模型拓展为三叉树期权定价模型,提升了计算的精确度。对产学研合作的利益分配问题进行了系统地研究,为因利益分配不当而导致破裂的产学研联盟提供借鉴和参考,目的是维护产学研合作的长久发展。希望本研究能够对日后的产学研合作利益分配问题提供一定的启示。