人脑胶质瘤恶性进展基因表达谱中葡萄糖代谢相关基因分析

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【目的】建立人脑胶质瘤恶性进展相关基因表达谱,分析其中葡萄糖代谢相关基因的表达差异,选择有进一步研究价值的基因,以临床标本进行检测论证,为进一步研究细胞葡萄糖代谢相关基因在胶质瘤恶性进展中的作用提供依据。 【方法】1.标本收集:收集同一患者初发和两次复发的胶质瘤组织,其病理形态学诊断依次为:神经节胶质瘤(WHO Ⅱ级)、间变性星型细胞瘤(WHO Ⅲ级)和多形性胶质母细胞瘤(WHO Ⅳ级)。同时取得了第二次复发时远离肿瘤的正常脑组织作为相对正常对照。2.cDNA microaray技术检测三份肿瘤组织和相对正常脑组织中差异基因的表达,建立胶质瘤恶性进展相关基因表达谱。3.根据GENEBANK和GENECARD的生物信息学资料,由人脑胶质瘤恶性进展基因表达谱中筛选参与肿瘤恶性进展过程的葡萄糖代谢相关基因。4.应用半定量RT-PCR检测、验证所筛选的人脑胶质瘤葡萄糖代谢相关基因在各级胶质瘤临床标本中的表达情况。 【结果】1.筛选出与胶质瘤恶性进展相关的葡萄糖代谢相关基因10条,其中基因PFK(磷酸果糖激酶)、PyK(丙酮酸激酶)、Tra(转醛酶)、citrate synthase(柠檬酸合成酶)、isocitrate dehydrogenase(异柠檬酸脱氢酶)、LDH-A(乳酸脱氢酶A)、L-xylulose reductase(L-木酮糖还原酶)、Glut5(葡萄糖转运体5)等均表现为表达上调,而HK1(己糖激酶1)、LDH-B(乳酸脱氢酶B)则表现为下调。2.临床标本的半定量RT-PCR检测人脑胶质瘤恶性进展相关基因表达谱中葡萄糖代谢相关基因分析中文摘要验证以上基因在胶质瘤中表达水平,其结果与芯片结果相符。【结论】我们利用基因芯片成功建立了胶质瘤恶性进展相关基因表达谱并应用生物信息学技术分析了胶质瘤恶性进展的基因表达谱,得到了10条与葡萄糖代谢相关的基因,进一步的信息检索提示其中的Tra基因可能是关键基因,值得进一步作细致的研究。半定量RT-PCR技术检测验证了以上基因在不同级别胶质瘤临床标本中表达水平,其结果与芯片结果相符。
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